应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何获得转录调控网络？
51/1返回列表
查看: 4713  |  回复: 29
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

limits999

木虫 (正式写手)

[交流] 如何获得转录调控网络？

最近想研究转录调控网络，但寻找了一下，发现转录因子对基因的调控信息不知道如何获得。麻烦有经验的大侠们提供一些可供下载的数据库资源或者资料啊，最好是免费的。
注：我最近试了Transfac、JARSPAR、TRRD等，但发现它们都只是提供转录因子的结合位置序列信息，而不是具体结合的基因信息，并且有些还收费。
而我想知道的是转录因子到底都结合了哪些基因的启动子区！
谢谢大侠告知啊！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息学 系统生物学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-04-25 16:11:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

limits999

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
24楼: Originally posted by hooking at 2012-05-02 02:52:47:
取决于你需要的species，mammalian 还是 其他 model system？ Yeast的转录调控网络会相对完整一些，mammalian的估计要猴年马月才能搞清楚。至少免费的关于人的数据库都很有限。收费的数据库相对好一些，像transfa ...

谢谢您的详细回答
赞一下 回复此楼
25楼2012-05-02 08:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答

robertorun

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励交流~ 2012-04-27 13:10:02
那你去按结合位置序列信息去搜索比对基因的启动子区域，在由启动子找到对应的基因！
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

limits999
2楼2012-04-26 09:45:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shyu_en

金虫 (小有名气)
★
limits999(金币+1): 谢谢参与
说到底，这时候就看内功了，平时文献阅读量很重要的。
赞一下 回复此楼
6楼2012-04-27 08:49:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励鼓励~ 2012-04-27 13:10:14
你还是还先看些生物大分子网络的系统的基础参考书为好，很多东西不是一两句话说得清楚的。
BIOLOGICAL NETWORKS（2007）http://ishare.iask.sina.com.cn/f/18454396.html
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

limits999
7楼2012-04-27 10:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭