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limits999

木虫 (正式写手)


[交流] 如何获得转录调控网络?

最近想研究转录调控网络,但寻找了一下,发现转录因子对基因的调控信息不知道如何获得。麻烦有经验的大侠们提供一些可供下载的数据库资源或者资料啊,最好是免费的。
注:我最近试了Transfac、JARSPAR、TRRD等,但发现它们都只是提供转录因子的结合位置序列信息,而不是具体结合的基因信息,并且有些还收费。
而我想知道的是转录因子到底都结合了哪些基因的启动子区!
谢谢大侠告知啊!
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limits999

木虫 (正式写手)


引用回帖:
19楼: Originally posted by toflyfirst at 2012-04-29 20:40:19:
我就知道个KEGG,希望有用

谢谢,不过现在的KEGG需要收费啊。。。
22楼2012-05-01 16:51:33
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查看全部 30 个回答

robertorun

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励交流~ 2012-04-27 13:10:02
那你去按结合位置序列信息去搜索比对基因的启动子区域,在由启动子找到对应的基因!

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2楼2012-04-26 09:45:24
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shyu_en

金虫 (小有名气)


★
limits999(金币+1): 谢谢参与
说到底,这时候就看内功了,平时文献阅读量很重要的。
6楼2012-04-27 08:49:28
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★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励鼓励~ 2012-04-27 13:10:14
你还是还先看些生物大分子网络的系统的基础参考书为好,很多东西不是一两句话说得清楚的。
BIOLOGICAL NETWORKS(2007)http://ishare.iask.sina.com.cn/f/18454396.html

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-04-27 10:59:05
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