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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 聚合物链建晶胞时，Amorphous Cell模块没法用，求解释
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sunhao123

禁虫 (小有名气)
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1楼 2012-04-22 12:16:55
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caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunhao123: 金币+5, 谢谢 2012-04-23 16:51:23
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-23 18:35:48
引用回帖:
3楼: Originally posted by sunhao123 at 2012-04-23 15:01:55:
麻烦问下，我是建立苯乙烯-二乙烯苯的聚合物，运用的是random polymer，链长76，可能性分别为0.9和0.1。
首先是运用forcite进行的结构优化，力场是compass，加和方法是atom based，其余为缺省值。
优化完后便运 ...

貌似聚合物选其他力场会好点，我现在只做小有机分子的模拟，用COMPASS可以，但是很多聚合物的力场选择会不一样，建议参考文献
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自强不息
5楼2012-04-23 16:29:54
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caijj09

木虫 (职业作家)
★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-23 10:33:25
sunhao123: 回帖置顶 2012-04-23 15:01:46
操作情况不明，不好判断。有时候是力场选择，有时候是非键合力选取不对
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自强不息
2楼2012-04-23 10:05:29
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sunhao123

禁虫 (小有名气)
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3楼2012-04-23 15:01:55
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caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunhao123: 金币+5, 谢谢 2012-04-23 16:50:10
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-24 00:12:03
引用回帖:
3楼: Originally posted by sunhao123 at 2012-04-23 15:01:55:
麻烦问下，我是建立苯乙烯-二乙烯苯的聚合物，运用的是random polymer，链长76，可能性分别为0.9和0.1。
首先是运用forcite进行的结构优化，力场是compass，加和方法是atom based，其余为缺省值。
优化完后便运 ...

文献中的力场时选择COMPASS么？你换个力场试试，同时注意换力场后，加和方法也调下。具体怎么调我也不太清楚，只能凭经验了。你用Forcite优化完后，先看下结果文件，看里面有没有提示。有时候虽然运行成功，但是有些参数并不能正确计算。我就遇到过这种情况
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自强不息
4楼2012-04-23 16:28:35
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