24小时热门版块排行榜    

查看: 3564  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

VASP_2012

新虫 (小有名气)

[求助] 采用PBS脚本第一次提交任务,算了1步就被杀死,有错误提示但不知道原因?

PBS脚本如下:

## Specify the job name
##PBS -S /bin/sh
#PBS -N  new
##PBS -q zhou
## Join the standard error and the standard output into 1 file output
#PBS -j oe
##PBS -m be
#PBS -V
## Set number of nodes and number of processor per node
#PBS -l nodes=2:ppn=2
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun  -np 4 vasp
rm -rf $PBS_JOBID-$PBS_JOBCOOKIE.hosts


错误提示如下:
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.112962560756E+03    0.11296E+03   -0.69848E+03  1512   0.693E+02
mpirun: killing job...
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 32211 on node r1i3n3 exited on signal 0 (Unknown signal 0).
--------------------------------------------------------------------------
mpirun: clean termination accomplished

请问是什么原因造成的?应该如何修改?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-24 17:25:25
个人觉得可能是vasp并行编译有问题,不妨把优化级别稍调低点试试。
6楼2012-04-24 16:19:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

tangsw911

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 多谢提示 2012-04-22 09:47:35
看看是不是你的计算任务太大了,内存不够用了
2楼2012-04-22 09:28:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

VASP_2012

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tangsw911 at 2012-04-22 09:28:32:
看看是不是你的计算任务太大了,内存不够用了

不是滴啊。
如果用1个节点1个CPU能计算2步,然后停止。
如果用2个节点2个CPU能计算1步,然后停止。
继续等待高手。。。
3楼2012-04-22 16:06:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢帮助~~ 2012-04-23 08:22:09
##PBS -S /bin/sh
只要一个#

这句都被你注释掉了

肯定只算几秒就删临时文件了
4楼2012-04-23 07:47:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么 +3 18834002860 2026-10-12 6/300 2026-10-15 14:30 by 长沙摩尔信息科�
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+7 David1982 2026-10-13 11/550 2026-10-15 10:30 by zyqchem
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
信息提示
请填处理意见