| 查看: 974 | 回复: 12 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
amber怎么更改计算的CPU设置？
|
|||
| 我打算在集群上计算AMBER，但是默认的是一个CPU，如何更改才能设置成2个CPU呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
291求调剂
已经有7人回复
-
300求调剂
已经有8人回复
-
求调剂推荐
已经有7人回复
-
289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校)
已经有4人回复
-
0854求调剂
已经有13人回复
-
初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂
已经有3人回复
-
药学求调剂
已经有14人回复
-
327求调剂
已经有27人回复
-
急需调剂
已经有5人回复
-
271求调剂
已经有33人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 石墨稀单侧加氢 形成能的计算
已经有6人回复
- 根据某种蛋白质的氨基酸分析结果计算htot（水解度要用的常数值）
已经有11人回复
- 问题：vasp计算突然中断，cpu利用率显示为0，这是什么情况，没有断电
已经有3人回复
- linux gaussian计算 怎么限制cpu 不让它100%阿
已经有6人回复
- 【求助】关于单机2cpu8核的mpich2设置问题！
已经有5人回复
- 【求助】MS计算CPU占用率问题，求教
已经有17人回复
- 【求助】如果把独显笔记本里的独显取下 可以使用CPU自带的集显吗
已经有6人回复
- 【讨论】为何CPU核心速度和主频不一致？
已经有4人回复
- 【求助】关于双cpu8核计算机运行gaussian的设置问题。
已经有18人回复
liyincumt
金虫 (职业作家)
小学生
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 22498.2
- 散金: 741
- 红花: 5
- 帖子: 3278
- 在线: 665小时
- 虫号: 379584
- 注册: 2007-05-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-04-20 15:57:31
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-04-20 15:57:31
|
不好意思，如果楼主是运行AMBER/ADF时，可以加上num_threads关键词来设置计算的CPU。 不知道楼主用的是什么Linux,在Ubuntu下，需要安装MPI。 以下为转帖： 下载openmpi, 我用的是openmpi-1.3.2.tar.gz, 解压到 /usr/local 进入目录，配置sudo ./onfigure –prefix=/opt/openmpi sudo make sudo make install .bashrc中设置环境变量 export MPI_HOME=/opt/openmpi export PATH=$PATH:$MPI_HOME/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MPI_HOME/lib cd $AMBERHOME/src make clean ./configure_amber -openmpi gfortran make parallel完了后生成sander.MPI done! |
5楼2012-04-19 21:07:39
liyincumt
金虫 (职业作家)
小学生
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 22498.2
- 散金: 741
- 红花: 5
- 帖子: 3278
- 在线: 665小时
- 虫号: 379584
- 注册: 2007-05-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-04-18 21:41:07
3楼2012-04-19 08:45:03
liyincumt
金虫 (职业作家)
小学生
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 22498.2
- 散金: 741
- 红花: 5
- 帖子: 3278
- 在线: 665小时
- 虫号: 379584
- 注册: 2007-05-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2012-04-19 21:08:49
