| 查看: 996 | 回复: 12 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
amber怎么更改计算的CPU设置？
|
||
| 我打算在集群上计算AMBER，但是默认的是一个CPU，如何更改才能设置成2个CPU呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
申博/考博
已经有8人回复
-
291求调剂
已经有12人回复
-
一志愿A区211，22408 321求调剂
已经有8人回复
-
295分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有13人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有6人回复
-
期刊推荐
已经有5人回复
-
有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业
已经有7人回复
-
又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗
已经有4人回复
-
337求调剂
已经有3人回复
11楼2012-04-20 16:09:18
liyincumt
金虫 (职业作家)
小学生
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 22508.2
- 散金: 741
- 红花: 5
- 帖子: 3280
- 在线: 665小时
- 虫号: 379584
- 注册: 2007-05-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-04-18 21:41:07
3楼2012-04-19 08:45:03
liyincumt
金虫 (职业作家)
小学生
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 22508.2
- 散金: 741
- 红花: 5
- 帖子: 3280
- 在线: 665小时
- 虫号: 379584
- 注册: 2007-05-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-04-20 15:57:31
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-04-20 15:57:31
|
不好意思，如果楼主是运行AMBER/ADF时，可以加上num_threads关键词来设置计算的CPU。 不知道楼主用的是什么Linux,在Ubuntu下，需要安装MPI。 以下为转帖： 下载openmpi, 我用的是openmpi-1.3.2.tar.gz, 解压到 /usr/local 进入目录，配置sudo ./onfigure –prefix=/opt/openmpi sudo make sudo make install .bashrc中设置环境变量 export MPI_HOME=/opt/openmpi export PATH=$PATH:$MPI_HOME/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MPI_HOME/lib cd $AMBERHOME/src make clean ./configure_amber -openmpi gfortran make parallel完了后生成sander.MPI done! |
5楼2012-04-19 21:07:39
5