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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ds做动力学优化
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

[求助] ds做动力学优化

各位大侠，小弟是ds的初学者。现在要做蛋白质复合物的优化，但在跑完动力学优化后（success），在output文件夹里只有一个构象。不知道是什么原因，请各位大侠给予帮助，小弟不胜感激。还有是蛋白质有两个残基是无效的，如何给予修复。谢谢望帮助
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学好专业知识
1楼 2012-04-17 21:04:49
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yuguangyun

新虫 (小有名气)
不好意思，没能解决小弟的问题。望楼主给帮主啊
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学好专业知识
2楼2012-04-17 21:08:08
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q1036210267

木虫 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 模拟EPI-1, 违规存档, 顶贴不对应求助，下次注意，没有助于的回帖请选择不应助，存档一次，下次加罚 2012-04-20 09:43:04
帮楼主 顶下，ds 我不大懂，我做的 是MD
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生活中坚持快乐的原则不改变，学习工作中踏实上进！`~`
3楼2012-04-18 09:06:42
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yuguangyun

新虫 (小有名气)
金币很少，还烦楼主给予帮助啊
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学好专业知识
4楼2012-04-18 13:52:18
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yuguangyun

新虫 (小有名气)
lz真不给力
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学好专业知识
5楼2012-04-19 08:03:36
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wavingsea9911

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-20 09:43:23
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-20 09:44:34
蛋白质无效残基是什么意思？用clean protein 试一下，看能不能处理。
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6楼2012-04-20 09:35:41
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yuguangyun

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wavingsea9911 at 2012-04-20 09:35:41:
蛋白质无效残基是什么意思？用clean protein 试一下，看能不能处理。

我也不太清楚，再打开蛋白质report里面，显示两个残基是invalid，我就把他们mutate了
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学好专业知识
7楼2012-04-20 18:46:43
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