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yuguangyun

新虫 (小有名气)

[求助] ds做动力学优化

各位大侠,小弟是ds的初学者。现在要做蛋白质复合物的优化,但在跑完动力学优化后(success),在output文件夹里只有一个构象。不知道是什么原因,请各位大侠给予帮助,小弟不胜感激。还有是蛋白质有两个残基是无效的,如何给予修复。谢谢望帮助
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学好专业知识
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

不好意思,没能解决小弟的问题。望楼主给帮主啊
学好专业知识
2楼2012-04-17 21:08:08
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q1036210267

木虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z: 模拟EPI-1, 违规存档, 顶贴不对应求助,下次注意,没有助于的回帖请选择不应助,存档一次,下次加罚 2012-04-20 09:43:04
帮楼主 顶下,ds 我不大懂,我做的 是MD
生活中坚持快乐的原则不改变,学习工作中踏实上进!`~`
3楼2012-04-18 09:06:42
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

金币很少,还烦楼主给予帮助啊
学好专业知识
4楼2012-04-18 13:52:18
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

lz真不给力
学好专业知识
5楼2012-04-19 08:03:36
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wavingsea9911

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-20 09:43:23
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-20 09:44:34
蛋白质无效残基是什么意思?用clean protein 试一下,看能不能处理。
6楼2012-04-20 09:35:41
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wavingsea9911 at 2012-04-20 09:35:41:
蛋白质无效残基是什么意思?用clean protein 试一下,看能不能处理。

我也不太清楚,再打开蛋白质report里面,显示两个残基是invalid,我就把他们mutate了
学好专业知识
7楼2012-04-20 18:46:43
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