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汕头大学海洋科学接受调剂
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duchunmei

金虫 (小有名气)

[交流] 怎样根据中间产物找过渡态？

本人，把中间体已经优化完了，试着找了一些过渡态，但是都算的过程中死掉了，请教一下高手如何怎样根据中间产物找过渡态？有没有什么窍门？
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1楼 2012-04-15 13:31:51
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lixiaocat

银虫 (小有名气)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
把要断裂的键和要生成的键分别伸长20% 用ts找
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4楼2012-04-16 10:17:48
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purplez

新虫 (初入文坛)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
看看高斯手册
用 QST2
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2楼2012-04-15 18:08:38
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mu00mu8

银虫 (初入文坛)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
楼主可以请教下你是怎么找中间产物的么？   通过实验么还是通过计算得到的？  我刚接触量化哈……
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3楼2012-04-15 22:34:37
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jarry@zyy

新虫 (小有名气)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
用QST2方法找出来的过渡态很多都不是想要的过渡态，不过作为初学者可以尝试一下。
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5楼2012-04-16 10:41:25
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mu00mu8 at 2012-04-15 22:34:37:
楼主可以请教下你是怎么找中间产物的么？   通过实验么还是通过计算得到的？  我刚接触量化哈……

我是通过用高斯优化得到的
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mu00mu8
6楼2012-04-16 19:12:53
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by purplez at 2012-04-15 18:08:38:
看看高斯手册
用 QST2

谢谢哦，刚接触，还不是很懂。
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7楼2012-04-16 19:14:19
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lixiaocat at 2012-04-16 10:17:48:
把要断裂的键和要生成的键分别伸长20% 用ts找

O(∩_∩)O谢谢，刚接触计算不大懂，你说的ts法，在高斯手册里有吗？
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8楼2012-04-16 19:45:30
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mu00mu8

银虫 (初入文坛)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
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6楼: Originally posted by duchunmei at 2012-04-16 19:12:53:
我是通过用高斯优化得到的

哦？  可以说的具体点么？怎么从反应物的构型优化得到中间产物的构型的？  优化的关键字是？
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9楼2012-04-17 09:27:00
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by mu00mu8 at 2012-04-17 09:27:00:
哦？  可以说的具体点么？怎么从反应物的构型优化得到中间产物的构型的？  优化的关键字是？

我做的是反应历程的，根据别人做出来的历程，自己用gaussview做一个构型加上命令算的，命令是我导师弄得
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mu00mu8
10楼2012-04-17 09:36:57
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mu00mu8

银虫 (初入文坛)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by duchunmei at 2012-04-17 09:36:57:
我做的是反应历程的，根据别人做出来的历程，自己用gaussview做一个构型加上命令算的，命令是我导师弄得

你用gv做的构型是反应物的构型还是直接是中间产物的构型？  是不是根据别人做出来的历程直接构建中间产物的构型然后对中间产物进行的优化？  麻烦你了哈~
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11楼2012-04-17 10:51:59
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meteoric30

木虫 (正式写手)
★
duchunmei(金币+1): 谢谢参与
强烈建议看小卒的faq。。。。
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12楼2012-04-17 11:12:57
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by mu00mu8 at 2012-04-17 10:51:59:
你用gv做的构型是反应物的构型还是直接是中间产物的构型？  是不是根据别人做出来的历程直接构建中间产物的构型然后对中间产物进行的优化？  麻烦你了哈~

是根据别人做出来的历程直接构建反应物，中间产物的构型然后对它们进行的优化
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mu00mu8
13楼2012-04-18 08:20:27
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duchunmei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by meteoric30 at 2012-04-17 11:12:57:
强烈建议看小卒的faq。。。。

O(∩_∩)O谢谢，
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14楼2012-04-18 08:20:59
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mu00mu8

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by duchunmei at 2012-04-18 08:20:27:
是根据别人做出来的历程直接构建反应物，中间产物的构型然后对它们进行的优化

嗯  明白了  谢谢楼主哈~
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15楼2012-04-18 08:41:36
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lixiaocat

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by duchunmei at 2012-04-16 19:14:19:
谢谢哦，刚接触，还不是很懂。

高斯里面有 就三种方法找过渡态 ts  qst2 qst3。 ts方法比较可靠，但是对初始构型要求比较严格。另外两种需要优化反应物、生成物，我没用过。找过渡态是很麻烦的，很少能一次就找到。慢慢来吧
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16楼2012-04-18 09:24:27
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