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hxr8086

木虫 (正式写手)

[求助] 拓扑分析-为什么这个srs拓扑还可以用cys表示?

附件中是一个晶体结构。很明显这是一个3连接的srs拓扑的结构(如果把双核的Zn看成一个节点)。可审稿人说这个结构还可以用cys来表示(我查了一下cys拓扑是(3,6)连接 实例是RIZXUT)。我用topos软件拟合了半天也没用变成cys拓扑。想问一下他是如选择节点才能变成cys拓扑的?
     审稿人说这个拓扑 “standard is cys, cluster is srs, You will learn that the structure can be described as "srs" or as "cys" depending on the description ”   是不是说“标准表示是cys,如果把金属簇看成一个节点则是srs”的意思?

    为方便分析,附件中晶体结构我已经进行了简化,实际结构是一个BTC-Zn的化合物。谢谢![ Last edited by hxr8086 on 2012-4-14 at 19:35 ]
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  • 附件 1 : 1.res
  • 2012-04-14 17:39:40, 2.23 K

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calebby

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【答案】应助回帖

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楼主可以把完整的cif文件传上来,大家一起来看看。。
2楼2012-04-14 20:12:52
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hxr8086

木虫 (正式写手)

请教一下为什么需要cif呢?我认为只要res做拓扑分析就够了。cif在附件中。
3楼2012-04-14 20:32:28
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hxr8086

木虫 (正式写手)

请教一下为什么需要cif呢?我认为只要res做拓扑分析就够了。cif在附件中。

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  • 附件 1 : 1.cif
  • 2012-04-14 20:33:44, 21.89 K
4楼2012-04-14 20:34:19
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hxr8086: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢回答 2012-04-15 14:36:24
引用回帖:
4楼: Originally posted by hxr8086 at 2012-04-14 20:34:19:
请教一下为什么需要cif呢?我认为只要res做拓扑分析就够了。cif在附件中。

cif和res都可以,可能是他习惯了
5楼2012-04-14 20:47:57
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guofeng1510

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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木瓜少爷: 金币+1, 鼓励回帖应助~ 2012-04-15 00:08:42
hxr8086: 金币+8, ★★★很有帮助, 明白了,非常感谢 2012-04-15 14:35:26
应该是把均苯三酸做为了六连接点,而每一个锌做为了三连接点。不过一般还是把簇认为是一个接点,三连接的更为合理一些。仅供参考。
6楼2012-04-14 21:07:00
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calebby

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jjxiang: 金币+2, 欢迎热心的虫子···· 2012-04-14 23:24:00
hxr8086: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 明白了,非常感谢 2012-04-15 14:35:51
我认为把它简化为srs比较好,但把它简化成cys这种方式是keeffe提倡的。把BTC简化成一个点,与周围的6个Zn连接(3个簇)就能画出cys拓扑。我用diamond画了一下,楼主可以看看。

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  • 附件 1 : 1.diamdoc
  • 2012-04-14 21:57:52, 26.91 K
7楼2012-04-14 21:57:54
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txq2009

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该是简化方式不一样导致,编辑还挺较真
8楼2012-04-15 08:26:14
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