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汕头大学海洋科学接受调剂
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

[求助] 服务器计算能带结构后,读不出能带结构图。

在我计算能带结构之前先做几何优化。首先我从file和save file里面生成并提交了*.input和*.car文件进行几何优化,优化成功。值得一提的是,在save file之前我没有勾选任何性质计算,因为首先做的只是几何优化嘛。然后,我想计算能带结构,在性质里面勾选了能带结构后从file和save file里面结果文件里面再次提交*.input和*.car两个文件,但是计算结束后,日志文件显示计算成功,就是没有*_BandStr.outmol文件,只是有个*.outmol文件。最主要的是,在分析里面不能生成能带结构图。各位虫友,有人知道这该怎么解决吗?
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

或者说,有人能告诉我DMol3提交“几何优化”和“能带结构”计算任务到服务器的正确步骤和所需正确文件吗?盼望各位虫友解决我的燃眉之急,谢谢大家。
2楼2012-04-14 10:56:26
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z: 金币+1, 专家考核, 鼓励交流 2012-04-14 16:20:58
seuzzj: 金币+1 2012-04-16 22:36:31
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?
思想重于技巧,内涵重于表象
3楼2012-04-14 13:27:47
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?

从来没有用过gateway这种方法。请问,具体该怎么做呢?
4楼2012-04-14 14:38:18
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-14 16:21:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-14 14:38:18:
从来没有用过gateway这种方法。请问,具体该怎么做呢?

跟本机计算提交方式完全一样,就是选择的gateway是服务器的而已~
具体的添加gateway可以参考帮助文件
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2012-04-14 15:00:19
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?

这位大侠,小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后,再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件,但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会利用结果文件读能带结构图。在此特地请教大侠,该如何利用结果文件读出能带结构图?
6楼2012-04-15 20:00:55
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 多谢交流 2012-04-16 08:33:38
引用回帖:
6楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-15 20:00:55:
这位大侠,小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后,再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件,但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会 ...

俺不系大侠,表一口一个大侠的叫,感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件,xsd文件?大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze,看到你就明白了。
顺便,这些都是help文件里详细说明了的,看那个比来问人更效率,能学到的更多,学习态度也更端正,不是么?
思想重于技巧,内涵重于表象
7楼2012-04-15 21:03:39
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by souledge at 2012-04-15 21:03:39:
俺不系大侠,表一口一个大侠的叫,感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件,xsd文件?大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze,看到你就明白了。
顺便,这些都是help文件里详细 ...

其实你说的我都会。只是现在的问题是,我在服务器提交的方式也只能是提交文件,就是我说的那种,用不了Gataway的。另外,返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是,结果文件里面的日志文件提示我计算成功。但是我就是找不到相应的文件来读出这个能带结构图。help文件我也在看。很难找到正确的方法。
8楼2012-04-16 12:53:15
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 专家考核, 谢谢回帖交流。。。 2012-04-16 16:28:36
引用回帖:
8楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-16 12:53:15:
其实你说的我都会。只是现在的问题是,我在服务器提交的方式也只能是提交文件,就是我说的那种,用不了Gataway的。另外,返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是,结果文件里面的日志文件 ...

难道没有打开gateway?或者没有在防火墙开放gateway?gateway的打开是在脚本:{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口(如果已经占用,看18889端口)是否在允许连接的列表中。
直接使用服务器提交计算是不生成xsd等模型文件的,因为这个过程不调用任何Visualizer的内容。即使是在Windows下用命令或者文件提交,也无法得到相应的xsd文件~
思想重于技巧,内涵重于表象
9楼2012-04-16 13:59:52
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-04-16 13:59:52:
难道没有打开gateway?或者没有在防火墙开放gateway?gateway的打开是在脚本:{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口(如果已经占用,看18889端口) ...

那么在提交文件计算的方式下该如何读出能带结构图呢?结果文件里面的日志文件提示计算成功。这个问题困扰了我好久了,恳求赐教!
10楼2012-04-16 15:06:35
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