24小时热门版块排行榜    

查看: 1325  |  回复: 11

seuzzj

铜虫 (小有名气)

[求助] 服务器计算能带结构后,读不出能带结构图。

在我计算能带结构之前先做几何优化。首先我从file和save file里面生成并提交了*.input和*.car文件进行几何优化,优化成功。值得一提的是,在save file之前我没有勾选任何性质计算,因为首先做的只是几何优化嘛。然后,我想计算能带结构,在性质里面勾选了能带结构后从file和save file里面结果文件里面再次提交*.input和*.car两个文件,但是计算结束后,日志文件显示计算成功,就是没有*_BandStr.outmol文件,只是有个*.outmol文件。最主要的是,在分析里面不能生成能带结构图。各位虫友,有人知道这该怎么解决吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuzzj

铜虫 (小有名气)

或者说,有人能告诉我DMol3提交“几何优化”和“能带结构”计算任务到服务器的正确步骤和所需正确文件吗?盼望各位虫友解决我的燃眉之急,谢谢大家。
2楼2012-04-14 10:56:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z: 金币+1, 专家考核, 鼓励交流 2012-04-14 16:20:58
seuzzj: 金币+1 2012-04-16 22:36:31
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?
思想重于技巧,内涵重于表象
3楼2012-04-14 13:27:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?

从来没有用过gateway这种方法。请问,具体该怎么做呢?
4楼2012-04-14 14:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-14 16:21:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-14 14:38:18:
从来没有用过gateway这种方法。请问,具体该怎么做呢?

跟本机计算提交方式完全一样,就是选择的gateway是服务器的而已~
具体的添加gateway可以参考帮助文件
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2012-04-14 15:00:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么?为什么要save file然后只提交file呢?

这位大侠,小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后,再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件,但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会利用结果文件读能带结构图。在此特地请教大侠,该如何利用结果文件读出能带结构图?
6楼2012-04-15 20:00:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 多谢交流 2012-04-16 08:33:38
引用回帖:
6楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-15 20:00:55:
这位大侠,小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后,再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件,但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会 ...

俺不系大侠,表一口一个大侠的叫,感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件,xsd文件?大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze,看到你就明白了。
顺便,这些都是help文件里详细说明了的,看那个比来问人更效率,能学到的更多,学习态度也更端正,不是么?
思想重于技巧,内涵重于表象
7楼2012-04-15 21:03:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by souledge at 2012-04-15 21:03:39:
俺不系大侠,表一口一个大侠的叫,感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件,xsd文件?大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze,看到你就明白了。
顺便,这些都是help文件里详细 ...

其实你说的我都会。只是现在的问题是,我在服务器提交的方式也只能是提交文件,就是我说的那种,用不了Gataway的。另外,返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是,结果文件里面的日志文件提示我计算成功。但是我就是找不到相应的文件来读出这个能带结构图。help文件我也在看。很难找到正确的方法。
8楼2012-04-16 12:53:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 专家考核, 谢谢回帖交流。。。 2012-04-16 16:28:36
引用回帖:
8楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-16 12:53:15:
其实你说的我都会。只是现在的问题是,我在服务器提交的方式也只能是提交文件,就是我说的那种,用不了Gataway的。另外,返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是,结果文件里面的日志文件 ...

难道没有打开gateway?或者没有在防火墙开放gateway?gateway的打开是在脚本:{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口(如果已经占用,看18889端口)是否在允许连接的列表中。
直接使用服务器提交计算是不生成xsd等模型文件的,因为这个过程不调用任何Visualizer的内容。即使是在Windows下用命令或者文件提交,也无法得到相应的xsd文件~
思想重于技巧,内涵重于表象
9楼2012-04-16 13:59:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuzzj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-04-16 13:59:52:
难道没有打开gateway?或者没有在防火墙开放gateway?gateway的打开是在脚本:{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口(如果已经占用,看18889端口) ...

那么在提交文件计算的方式下该如何读出能带结构图呢?结果文件里面的日志文件提示计算成功。这个问题困扰了我好久了,恳求赐教!
10楼2012-04-16 15:06:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 seuzzj 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 321求调剂 +4 大米饭! 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:41 by Linda Hu
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +6 Ncdx123456 2026-03-13 7/350 2026-03-16 07:44 by L135790
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-10 11/550 2026-03-14 12:18 by 邱gl
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:57 by JourneyLucky
[考研] 求调剂! +4 朔朔话 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:38 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 研究生招生 +3 徐海涛11 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:26 by 徐海涛11
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
[考研] 294 英二数二物化 求调剂 +6 米饭团不好吃 2026-03-09 6/300 2026-03-09 23:55 by barlinike
信息提示
请填处理意见