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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 服务器计算能带结构后，读不出能带结构图。
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seuzzj

铜虫 (小有名气)

[求助] 服务器计算能带结构后，读不出能带结构图。

在我计算能带结构之前先做几何优化。首先我从file和save file里面生成并提交了*.input和*.car文件进行几何优化，优化成功。值得一提的是，在save file之前我没有勾选任何性质计算，因为首先做的只是几何优化嘛。然后，我想计算能带结构，在性质里面勾选了能带结构后从file和save file里面结果文件里面再次提交*.input和*.car两个文件，但是计算结束后，日志文件显示计算成功，就是没有*_BandStr.outmol文件，只是有个*.outmol文件。最主要的是，在分析里面不能生成能带结构图。各位虫友，有人知道这该怎么解决吗？
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1楼 2012-04-14 10:36:33
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seuzzj

铜虫 (小有名气)
或者说，有人能告诉我DMol3提交“几何优化”和“能带结构”计算任务到服务器的正确步骤和所需正确文件吗？盼望各位虫友解决我的燃眉之急，谢谢大家。
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2楼2012-04-14 10:56:26
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 金币+1, 专家考核, 鼓励交流 2012-04-14 16:20:58
seuzzj: 金币+1 2012-04-16 22:36:31
直接在选择gateway的地方提交不就好了么？为什么要save file然后只提交file呢？
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思想重于技巧，内涵重于表象
3楼2012-04-14 13:27:47
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seuzzj

铜虫 (小有名气)
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3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么？为什么要save file然后只提交file呢？

从来没有用过gateway这种方法。请问，具体该怎么做呢？
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4楼2012-04-14 14:38:18
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-14 16:21:06
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4楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-14 14:38:18:
从来没有用过gateway这种方法。请问，具体该怎么做呢？

跟本机计算提交方式完全一样，就是选择的gateway是服务器的而已～
具体的添加gateway可以参考帮助文件
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2012-04-14 15:00:19
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seuzzj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-04-14 13:27:47:
直接在选择gateway的地方提交不就好了么？为什么要save file然后只提交file呢？

这位大侠，小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后，再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件，但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会利用结果文件读能带结构图。在此特地请教大侠，该如何利用结果文件读出能带结构图？
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6楼2012-04-15 20:00:55
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 多谢交流 2012-04-16 08:33:38
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6楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-15 20:00:55:
这位大侠，小弟还有一个问题。DMol3模块几何优化成功后，再提交任务到服务器进行能带结构计算。日志文件显示计算成功。下载了结果文件，但是不会使用结果文件读出能带结构图。也不知道是结果文件有问题还是我不会 ...

俺不系大侠，表一口一个大侠的叫，感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件，xsd文件？大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze，看到你就明白了。
顺便，这些都是help文件里详细说明了的，看那个比来问人更效率，能学到的更多，学习态度也更端正，不是么？
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思想重于技巧，内涵重于表象
7楼2012-04-15 21:03:39
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seuzzj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by souledge at 2012-04-15 21:03:39:
俺不系大侠，表一口一个大侠的叫，感觉自己都快要被煮了……
在MS中打开结果文件夹中的模型结构文件，xsd文件？大概是吧。然后Modules->Dmol3->Analyze，看到你就明白了。
顺便，这些都是help文件里详细 ...

其实你说的我都会。只是现在的问题是，我在服务器提交的方式也只能是提交文件，就是我说的那种，用不了Gataway的。另外，返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是，结果文件里面的日志文件提示我计算成功。但是我就是找不到相应的文件来读出这个能带结构图。help文件我也在看。很难找到正确的方法。
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8楼2012-04-16 12:53:15
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 专家考核, 谢谢回帖交流。。。 2012-04-16 16:28:36
引用回帖:
8楼: Originally posted by seuzzj at 2012-04-16 12:53:15:
其实你说的我都会。只是现在的问题是，我在服务器提交的方式也只能是提交文件，就是我说的那种，用不了Gataway的。另外，返回来的结果文件里面是没有*.xsd的。这就是困扰我的问题。但是，结果文件里面的日志文件 ...

难道没有打开gateway？或者没有在防火墙开放gateway？gateway的打开是在脚本：{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口（如果已经占用，看18889端口）是否在允许连接的列表中。
直接使用服务器提交计算是不生成xsd等模型文件的，因为这个过程不调用任何Visualizer的内容。即使是在Windows下用命令或者文件提交，也无法得到相应的xsd文件～
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思想重于技巧，内涵重于表象
9楼2012-04-16 13:59:52
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seuzzj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-04-16 13:59:52:
难道没有打开gateway？或者没有在防火墙开放gateway？gateway的打开是在脚本：{Accelrys}/Materials Studio 5.x/etc/Gateway/gwstart。打开Gateway后要查看iptables是否把18888端口（如果已经占用，看18889端口） ...

那么在提交文件计算的方式下该如何读出能带结构图呢？结果文件里面的日志文件提示计算成功。这个问题困扰了我好久了，恳求赐教！
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10楼2012-04-16 15:06:35
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