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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zdz103979358

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何用分子力学方法模拟

本人初学MS,用分子力学方法研究缓蚀剂分子在金属表面的自组装成膜机制。缓蚀剂分子在Fe(001)表面的覆盖度为0.64n㎡/个,即咪唑啉在Fe(001)表面达到饱和吸附。模拟体系大小为3.24nm×2.24nm×6.03nm,包含16个咪唑啉缓蚀剂分子。
  上述该如何构建。本人软件操作不熟,最好每一步骤写越详细越好。万分感谢。
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流,回到很赞! 2012-04-13 08:04:29
chaizhm: 金币+1, 极其欣赏你的回答~~ 2012-04-13 10:40:38
zdz103979358: 金币+5, 有帮助, 非常感谢哈 2012-04-23 12:03:58
你这样问问题是不可能得到答复的,建议你多看看文献中是如何处理的,然后参照MS的HELP中的例子来学习构建过程~
2楼2012-04-13 08:02:39
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caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-04-14 20:50:01
我也在做这方面的工作,但是没人指点,一个人根据文献,根据教程在做。很希望懂的人能给出好的建议,虽然楼上说的没错,但还是希望楼主多分包容,别人不懂,尤其是没学过量子化学,计算化学的同学,他们的要求只是想知道软件的操作,来做个简单的模拟,二楼没必要这么鄙视我们这种菜鸟。大家都是从菜鸟过来的。

再回到正题,楼主的问题,可以参考文献,软件的操作步骤可以参考教程中有关 内容:

构建结构:使用Build  | Crystal  

切表面 : Build | Surface   ——>cleave surface

结构优化,几何优化,可以用Discover

另外还涉及到建盒子的问题: 用Amorphous Cell  

至于怎么操作,看教程吧,涉及到的步骤太多了
自强不息
3楼2012-04-14 12:39:34
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sqbin0615

铁虫 (小有名气)

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖,下次扣金币 2012-06-13 13:38:53
我也是菜鸟,请问前辈们怎么查这方面的文献啊,怎么以ms为关键词搜索不出来啊
4楼2012-04-14 14:26:57
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geniusew

金虫 (小有名气)

楼主。。请问后来您成功分子模拟了吗
5楼2012-05-05 10:24:31
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zdz103979358

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by geniusew at 2012-05-05 10:24:31:
楼主。。请问后来您成功分子模拟了吗

没有呢,还在纠结
6楼2012-05-07 14:24:56
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xiuhui

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-14 12:39:34
我也在做这方面的工作,但是没人指点,一个人根据文献,根据教程在做。很希望懂的人能给出好的建议,虽然楼上说的没错,但还是希望楼主多分包容,别人不懂,尤其是没学过量子化学,计算化学的同学,他们的要求只是想 ...

太赞了
7楼2012-06-13 11:17:39
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lxhlxh

金虫 (正式写手)

我也是正在做,也不知所措,不过在导师建议下报名将参加创腾的一个暑期培训班,希望能有用。各位也不妨一试!
8楼2012-06-29 12:11:57
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lxhlxh at 2012-06-29 12:11:57
我也是正在做,也不知所措,不过在导师建议下报名将参加创腾的一个暑期培训班,希望能有用。各位也不妨一试!

问下这个培训班费用大概多少,有没有联系方式,谢谢
每个人只能陪你走一段路程
9楼2015-07-17 08:04:24
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