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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » G03计算RESP出错
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)

[求助] G03计算RESP出错

小弟，在算RESP的时候，用antechamber导入g03输入文件后，输出“No atom read in, the gaussian output file may not complete, exit”的报错，但是g03是正常结束的，请问有何解决办法啊？
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1楼 2012-04-10 11:26:11
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 13:56:46
zhengpc3505: 金币+1 2012-04-10 14:26:46
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....
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2楼2012-04-10 13:24:58
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2012-04-10 13:24:58:
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....

是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错
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3楼2012-04-10 14:07:51
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-10 23:01:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:07:51:
是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错

哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事本里，简单的记录一下这些命令是有什么作用，同时，以后再遇到此命令直接复制过来，这样就方便，而且容易排出错误。你也可以这样试试。
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4楼2012-04-10 14:15:30
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？
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5楼2012-04-10 14:28:47
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:28:47:
版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？

没有遇到过
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6楼2012-04-10 14:32:10
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-10 21:32:08
把你gaussian计算resp电荷的输入文件，贴出来看看呗
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7楼2012-04-10 20:43:05
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
8楼2012-04-11 01:37:19
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-04-11 01:37:19:
可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com

现在没有什么精华，我只是说的记录模拟过程中要用到的命令，这样方便检查
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9楼2012-04-11 08:01:15
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namediablo1

新虫 (初入文坛)
最后问题解决了吗？
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10楼2015-04-27 10:30:14
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