应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » G03计算RESP出错
101/1返回列表
查看: 1970  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhengpc3505

金虫 (小有名气)

[求助] G03计算RESP出错

小弟，在算RESP的时候，用antechamber导入g03输入文件后，输出“No atom read in, the gaussian output file may not complete, exit”的报错，但是g03是正常结束的，请问有何解决办法啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-10 11:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 13:56:46
zhengpc3505: 金币+1 2012-04-10 14:26:46
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-10 13:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2012-04-10 13:24:58:
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....

是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-10 14:07:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-10 23:01:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:07:51:
是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错

哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事本里，简单的记录一下这些命令是有什么作用，同时，以后再遇到此命令直接复制过来，这样就方便，而且容易排出错误。你也可以这样试试。
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-10 14:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-10 14:28:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:28:47:
版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？

没有遇到过
回复此楼
6楼2012-04-10 14:32:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-10 21:32:08
把你gaussian计算resp电荷的输入文件，贴出来看看呗
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-10 20:43:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com
赞一下 回复此楼
为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
8楼2012-04-11 01:37:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-04-11 01:37:19:
可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com

现在没有什么精华，我只是说的记录模拟过程中要用到的命令，这样方便检查
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-11 08:01:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

namediablo1

新虫 (初入文坛)
最后问题解决了吗？
赞一下 回复此楼
10楼2015-04-27 10:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhengpc3505 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 10:38 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-15 07:38 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:50 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:01 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:50 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-15 05:26 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 05:00 by mibUvS8DDCwf
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-14 23:24 by vZfe6xYu34yj
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:45 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:13 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 21:37 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭