应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » G03计算RESP出错
101/1返回列表
查看: 1924  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhengpc3505

金虫 (小有名气)

[求助] G03计算RESP出错

小弟，在算RESP的时候，用antechamber导入g03输入文件后，输出“No atom read in, the gaussian output file may not complete, exit”的报错，但是g03是正常结束的，请问有何解决办法啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-10 11:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 13:56:46
zhengpc3505: 金币+1 2012-04-10 14:26:46
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-10 13:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2012-04-10 13:24:58:
应该是导入输出文件啊，
antechamber -i gaussian.log -fi gout ....

是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-10 14:07:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-10 23:01:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:07:51:
是是是，笔误笔误，在导入了g03的输出文件作为antechamber的输入文件时报的错

哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事本里，简单的记录一下这些命令是有什么作用，同时，以后再遇到此命令直接复制过来，这样就方便，而且容易排出错误。你也可以这样试试。
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-10 14:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhengpc3505

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-10 14:28:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhengpc3505 at 2012-04-10 14:28:47:
版主，又遇到过计算RESP电荷出错的问题吗？

没有遇到过
回复此楼
6楼2012-04-10 14:32:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-10 21:32:08
把你gaussian计算resp电荷的输入文件，贴出来看看呗
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-10 20:43:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-04-10 14:15:30:
哈哈，看来多与人交流很重要啊，2楼一语中的，楼主就解决问题。
我在用gromacs 的时候，也经常打很多输入输出设置的命令，而且有时候这些命令时相同重复的，后来我就把每个模拟用到的命令都先打在一个txt 的记事 ...

可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com
赞一下 回复此楼
为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
8楼2012-04-11 01:37:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-04-11 01:37:19:
可否把你总结的精华传给我，谢谢，youzicxb@126.com

现在没有什么精华，我只是说的记录模拟过程中要用到的命令，这样方便检查
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-11 08:01:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

namediablo1

新虫 (初入文坛)
最后问题解决了吗？
赞一下 回复此楼
10楼2015-04-27 10:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhengpc3505 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭