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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » Gulp 拟合势函数 初值设置的问题
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afujie

木虫 (正式写手)

[求助] Gulp 拟合势函数 初值设置的问题

一、看了大家的很多的帖子 都说gulp拟合势函数初值的设置 对结果很重要 需要一定的经验 大家可以谈谈自己初值设置的经验吗？
其次 每次拟合完之后 需要进行迭代 是什么意思？是把输出文件中推荐的值带到gin文件中进行再次拟合吗？可是这样的一组参数值（上一次fit成功之后的推荐值）程序默认是拟合好的 不会再进行拟合啊 各位能不能帮我分析一下 问题出在哪？
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1楼 2012-04-08 23:50:33
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

老虎大王

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by afujie at 2012-04-25 20:29:18:
大王 想请教您一个问题
gulp拟合势函数 截断一般怎样选去呢？
比如说buck函数，我见例子中一般都是8,12，或者24的选，可是根据理论，一般都是算到第一到第三近邻，后面的作用就很小了，也就是5埃左右，为什么例 ...

离一个中心原子比较远的地方，涉及的配位原子也比较多。这里面就产生两个问题，一个问题是，虽然函数值在远的地方很小，但是因为涉及原子多，在总能量上积累起来的误差有可能还是很可观的，尤其是对于非晶和液体来说。另一个问题是，因为越远涉及原子越多，所以相互作用计算就越费时间。这是一对矛盾。但现在的计算机性能提高了，所以第二个问题的严重性就不是那么大了。选大一些，第一可以保证精确性，第二可以保证截断的平滑性。

对这个问题你要做一个测试，不是光测试势数值，而是要测试它算出来的整个系统的能量。
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10楼2012-04-26 14:34:38
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普通回帖

dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhangguangping: 金币+2, 谢谢指教！ 2012-04-09 16:57:33
afujie: 金币+5, ★有帮助 2012-04-12 09:12:12
拟合初值的确定，一靠经验二靠运气，三建议试试1stOpt，采用的是全局优化算法，不依赖初值。
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afujie
2楼2012-04-09 09:12:14
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afujie

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by dingd at 2012-04-09 09:12:14:
拟合初值的确定，一靠经验二靠运气，三建议试试1stOpt，采用的是全局优化算法，不依赖初值。

在经验这方面 都应该注意什么呢？
进行全局优化 会给出势函数的参数吗？这个我没有用过 能说详细点吗
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3楼2012-04-09 09:18:25
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
afujie: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-04-15 22:27:24
zhangguangping: 金币+2, 谢谢指导！ 2012-04-16 10:06:17
这个没有好的办法啊。主要靠运气。另外是靠大量的试验。经验嘛就是从大量试验中总结来的。要观察每个参数的变动所引起的结果的变化，以及某几个参数之间的协调关系。这个不是能说出来的，全靠自己灵活掌握。你试的次数多了，再加上运气好，就能拟合好；如果你试的次数少，运气又不好，就做不出来；你试的少，但运气好，也有可能出来；如果你试得多，但运气不好，还是出不来。
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4楼2012-04-15 21:57:02
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhangguangping: 金币+2, 谢谢建议！ 2012-04-16 10:06:26
另外我有一个很具体的建议，就是建议你多发动几个人和你一起做，大家分头做，然后讨论自己做的过程中有哪些发现。这个GULP，反正输入文件写好之后，谁都可以去做。你找几个本科生，专科生，高中生，都可以。有的人，运气还是相当好的。
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5楼2012-04-15 22:00:38
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afujie

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 老虎大王 at 2012-04-15 22:00:38:
另外我有一个很具体的建议，就是建议你多发动几个人和你一起做，大家分头做，然后讨论自己做的过程中有哪些发现。这个GULP，反正输入文件写好之后，谁都可以去做。你找几个本科生，专科生，高中生，都可以。有的人 ...

大王 那你说是不是拟合出来的数值 跟实验值的误差不能超过多少呢？5%？C44 和剪切模量都能符合的很好吗？
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6楼2012-04-15 22:29:06
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
dbb627: 金币+2, 谢谢应助！ 2012-04-26 14:06:20
引用回帖:
6楼: Originally posted by afujie at 2012-04-15 22:29:06:
大王 那你说是不是拟合出来的数值 跟实验值的误差不能超过多少呢？5%？C44 和剪切模量都能符合的很好吗？

误差多少算比较好呢？一般来说，能量和结构应该尽可能接近，我看文献上能量的优化值的误差基本上都是1%以内的，结构（晶格常数）也差不多是这样吧，也有误差稍微大一些的。这个不光要看相对误差，也要看绝对误差，总之感觉上要很接近，人家才会接受。各种模量，误差稍微大一些没有很大关系，毕竟不同的实验值之间也有不小的差别，你选定一组实验值，你的计算值和它差5%，或者10%以内我觉得都可以接受。比如100Gpa，你优化后出来的是90GPa，这也算是比较接近了。
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afujie
7楼2012-04-16 10:08:14
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afujie

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 老虎大王 at 2012-04-16 10:08:14:
误差多少算比较好呢？一般来说，能量和结构应该尽可能接近，我看文献上能量的优化值的误差基本上都是1%以内的，结构（晶格常数）也差不多是这样吧，也有误差稍微大一些的。这个不光要看相对误差，也要看绝对误差 ...

非常感谢 大王的指导
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8楼2012-04-16 10:50:31
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afujie

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 老虎大王 at 2012-04-15 21:57:02:
这个没有好的办法啊。主要靠运气。另外是靠大量的试验。经验嘛就是从大量试验中总结来的。要观察每个参数的变动所引起的结果的变化，以及某几个参数之间的协调关系。这个不是能说出来的，全靠自己灵活掌握。你试的 ...

大王 想请教您一个问题
gulp拟合势函数 截断一般怎样选去呢？
比如说buck函数，我见例子中一般都是8,12，或者24的选，可是根据理论，一般都是算到第一到第三近邻，后面的作用就很小了，也就是5埃左右，为什么例子中要选那么大呢？
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9楼2012-04-25 20:29:18
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