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[交流] AUTODOCK 经验交流和提问回答主题帖

autodock是一个免费的对接软件,其在众多高水平文章中被引用。作为一个autodock使用者来说,有必要和大家进行交流和讨论,因此,本版块想开展一下针对AUTODOCK的学习贴,希望大家积极提问,互相交流。
楼主的职责是:回答虫友的一些简单问题,上传一些AUTODOCK的教程。
也希望各位AUTODOCK的高手,能在该贴里积极回答大家的提问,也奉献一些自己的经验。希望各位支持!
4.2更新: 教程下载:http://good.gd/2001339.htm

[ 来自科研家族 寂寞大虫家族 ]

[ Last edited by zh1987hs on 2012-4-2 at 10:59 ]
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晓晓瑶

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
79楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-23 19:57:19
http://autodock.scripps.edu/resources/science/equations
关于autodock的打分函数可以看这个地方,里面是包含了范德华力这一项的,如果在dlg文件里这一项占总结合能的比例比较大的话,你可以推测范德华力在结合 ...

那么我的文件用pdb导出后,发现药物周围的氨基酸是非极性氨基酸占多数,那么可不可以用来证明范德华力的作用呢?
80楼2012-07-23 23:46:36
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yuguangyun

新虫 (小有名气)



zh1987hs(金币+1): 谢谢参与
望LZ多穿些教程,我是i初学者零基础
4楼2012-04-02 09:45:12
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简单回复
yaya2135楼
2012-04-02 10:05   回复  
zh1987hs(金币+1): 谢谢参与
2012-04-02 10:27   回复  
zh1987hs(金币+1): 谢谢参与
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