应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求解一个关于Dmol3 进行MD计算的小问题
51/1返回列表
查看: 2525  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

skkuwei

金虫 (正式写手)

[交流] 求解一个关于Dmol3 进行MD计算的小问题

想用MS里的Dmol模块尝试下MD计算 因为只是学习下简单的操作方法 问题如果太愚昧 还请包涵
1，进行计算的对象是一个包含100个原子左右的单个分子
2， 想看看在某一温度下 分子中可能会出现的断键 或者 通过其他小分子的进攻 可能会发生的一些化学反应

小女子的问题是：
1 需要给这个单一分子设定一个空间进行MD计算吗 如果需要的话怎么设置为好？
2 thermostat, Nose Q ratio, Nose chain length, Yoshida parameter这些选项和参数设置的功能和依据是什么？
3 Dmol MD计算要是不收敛 该调解什么参数为好？

回复即感恩！

谢谢

[ Last edited by skkuwei on 2013-6-11 at 14:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-03-30 19:24:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangll99

木虫 (职业作家)
★
skkuwei(金币+1): 谢谢参与
最近好多小女子啊
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-30 21:48:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

houfeifan

金虫 (小有名气)
★ ★
skkuwei(金币+1): 谢谢参与
zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-03-31 15:26:08
看看dmol的help文件吧，一眼难尽啊，有些东西还是需要了解一下的
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-30 22:04:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skkuwei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 409702500 at 2012-03-31 21:33:31:

要是能解答一下 就更好了
赞一下 回复此楼
6楼2012-04-01 21:14:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skkuwei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by houfeifan at 2012-03-30 22:04:44:
看看dmol的help文件吧，一眼难尽啊，有些东西还是需要了解一下的

谢谢 我会看的 要是能解答一下就更好了
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-01 21:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
skkuwei8楼
2012-04-01 21:15   回复  
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-03-30 21:48:48: 最近好多小女子啊

查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭