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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 染料敏化太阳能电池中有机染料分子吸附建模求助
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buct2010

金虫 (正式写手)

[求助] 染料敏化太阳能电池中有机染料分子吸附建模求助

最近看到有计算染料分子在TiO2表面吸附的文献
（J. Phys. Chem. C 2010, 114, 6054-6061）自己也想算用VASP算一些。
我想知道，下图里面的染料分子（其他的染料有N791，钌配合物N3，罗丹明B等）的模型是怎么建立的？直接从MS导入？还是从哪个数据库查源自坐标？希望大家赐教，不胜感激！
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1楼 2012-03-29 10:13:47
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lgxyz

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
buct2010: 金币+5, ★有帮助, 好的，我已经下载了CCDC，先试试看吧，里面没有的话就自己搭建吧，呵呵 2012-03-29 14:58:42
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-03-30 11:03:31
这种小分子是很容易建立，MS里也有相关的片段结构，或者用其他的分子构建软件搭建分子，然后将其坐标导入到MS中，最后拷到TiO2表面上就可以了。
这种吸附模型不可能有现成的坐标文件的，都是需要自己手动搭建。祝你好运！
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5楼2012-03-29 12:17:39
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huangll99

木虫 (职业作家)
★
fzx2008: 金币+1, 谢谢交流！ 2012-04-28 10:02:09
CCDC中可能有，没用过，不太清楚
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buct2010
2楼2012-03-29 10:22:21
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
buct2010: 金币+5, ★有帮助, 我现在找到的结构只有文献中提到的，没有具体的结构信息。 2012-03-29 10:42:26
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-03-30 11:03:11
这种结构明确的分子，应该有结构数据吧。

查出来，自己手动建一个相近的分子，然后做结构优化，然后就放到TiO2上吸附。

你看这样怎么样？
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3楼2012-03-29 10:28:31
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buct2010

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by huangll99 at 2012-03-29 10:22:21:
CCDC中可能有，没用过，不太清楚

谢谢你，这个CCDC我还没装过~
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4楼2012-03-29 10:40:48
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