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亍寞

金虫 (小有名气)

[求助] AIMALL 与AIM2000哪个好用点呢~

准备购买上述软件中的一个，但是不知道选哪个...AIM2000用试用版本的尝试了一下，觉得虽然数据乱一点，但是比较好用，AIMALL的话...略惭愧的现在还不知道输入啥文件...
发文章的话一般是AIM2000多一点，还是All多一点呢？哪个更可信或者说计算精度，输出数据的话更优质一点？作图的话，哪个放到文章里面好看一些之类的.........
还请知道的虫友们赐教~~~
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1楼2012-03-28 12:07:10
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-03-28 14:11:28
亍寞: 金币+6, 谢谢！ 2012-03-28 19:55:56
AIMALL更好，计算更快。可视化做的也很好。输入文件是一样的，都是wfn文件
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前途光明，出路难觅！
2楼2012-03-28 12:21:34
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vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-03-28 14:11:42
亍寞: 金币+6 2012-03-28 19:56:05
AIMAll的计算部分是免费的，而且没有原子个数限制，算起来也挺快，输入文件可以直接为fchk文件。AIMAll的图形部分是收费的。不过sobereva老师的multiwfn软件可以对AIM计算结果进行图形化显示。
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3楼2012-03-28 12:27:52
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
亍寞: 金币+6 2012-03-28 19:56:17
亍寞: 金币+2 2012-03-29 09:24:31
AIM2000操作方便，可直接图形化显示结果，但是速度颇慢（尤其是盆积分），且不支持并行，而且收费，也没Linux版。而且不够灵活，比如没法自行删减、修改临界点，没法导出键径坐标等。

AIMALL在积分速度和精度上明显优于AIM2000，但是没有直观的交互式操作的界面，输出文件比较繁杂，图形化模块还是收费的。输入文件方面，AIMALL不仅支持wfn文件还支持fch文件，也支持Gaussian09 B.01开始引入的wfx文件（在赝势计算时可以将内核电子正确表现出来）

Multiwfn在搜索临界点和生成键径方面和AIM2000用法很类似，也是很方便的交互式操作，在一般四核机子上速度比AIM2000快一两个数量级，结果可直接图形化显示。所有结果都可以方便地导出、导入、修改。Multiwfn免费、开源，同时有Linux版。Multiwfn像AIMALL一样支持fch、wfn、wfx三种文件用于AIM分析。目前Multiwfn还不支持盆积分（未来会加入），如果不需要盆积分的话Multiwfn是比AIM2000和AIMALL明显更好的选择。
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4楼2012-03-28 14:43:28
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-28 14:43:28:
AIM2000操作方便，可直接图形化显示结果，但是速度颇慢（尤其是盆积分），且不支持并行，而且收费，也没Linux版。而且不够灵活，比如没法自行删减、修改临界点，没法导出键径坐标等。

AIMALL在积分速度和精度上 ...

谢谢指点~multiwfn的确很好用，之前中的两篇文章都引用了您的程序...但是有一点不知道是我没有搞清楚使用方法还是什么，对于一些平面的分子，做出来的图很漂亮，但是有的时候立体分子，或者是想稍微调节一下图形的角度时候，比较困难......不知道这个是否会有解决方案？
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5楼2012-03-28 19:59:07
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2012-03-30 17:17:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by 亍寞 at 2012-03-28 19:59:07:
谢谢指点~multiwfn的确很好用，之前中的两篇文章都引用了您的程序...但是有一点不知道是我没有搞清楚使用方法还是什么，对于一些平面的分子，做出来的图很漂亮，但是有的时候立体分子，或者是想稍微调节一下图形 ...

非平面分子通常以体系内三个原子坐标的方式来定义平面，或者指定三个坐标点来定义平面。对于后者，为了获得坐标点，可以利用其它可视化工具作为辅助，比如可以在gview里在适当位置增加一个辅助原子，然后将原子的坐标输入进Multiwfn里即可。
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6楼2012-03-28 21:11:44
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-28 21:11:44:
非平面分子通常以体系内三个原子坐标的方式来定义平面，或者指定三个坐标点来定义平面。对于后者，为了获得坐标点，可以利用其它可视化工具作为辅助，比如可以在gview里在适当位置增加一个辅助原子，然后将原子的 ...

谢谢！
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7楼2012-03-29 09:24:20
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1maomao

金虫 (初入文坛)
AIMALL计算确实很快，比较机械化，我用的时候，计算原子的性质的时候出现过个别分子被程序识别不出来，原子性质也就没算出来，还得拿AIM2000算。两个程序各有长处。
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8楼2012-04-01 09:02:58
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 1maomao at 2012-04-01 09:02:58:
AIMALL计算确实很快，比较机械化，我用的时候，计算原子的性质的时候出现过个别分子被程序识别不出来，原子性质也就没算出来，还得拿AIM2000算。两个程序各有长处。

谢谢回复~大概是哪些分子不能被识别呢？原因是什么您知道么？
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9楼2012-04-04 16:53:51
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1maomao

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 亍寞 at 2012-04-04 16:53:51:
谢谢回复~大概是哪些分子不能被识别呢？原因是什么您知道么？

我刚开始学，对程序还不太了解，只是我在算苯环的π键和其他分子之间的卤键的时候，与卤原子相连的两个C原子的原子性质识别不出来。具体原因我也不知道。
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10楼2012-04-06 09:03:54
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