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亍寞

金虫 (小有名气)

[求助] AIMALL 与AIM2000哪个好用点呢~

准备购买上述软件中的一个,但是不知道选哪个...AIM2000用试用版本的尝试了一下,觉得虽然数据乱一点,但是比较好用,AIMALL的话...略惭愧的现在还不知道输入啥文件...
发文章的话一般是AIM2000多一点,还是All多一点呢?哪个更可信或者说计算精度,输出数据的话更优质一点?作图的话,哪个放到文章里面好看一些之类的.........
还请知道的虫友们赐教~~~
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-03-28 14:11:28
亍寞: 金币+6, 谢谢! 2012-03-28 19:55:56
AIMALL更好,计算更快。可视化做的也很好。输入文件是一样的,都是wfn文件
前途光明,出路难觅!
2楼2012-03-28 12:21:34
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vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-03-28 14:11:42
亍寞: 金币+6 2012-03-28 19:56:05
AIMAll的计算部分是免费的,而且没有原子个数限制,算起来也挺快,输入文件可以直接为fchk文件。AIMAll的图形部分是收费的。不过sobereva老师的multiwfn软件可以对AIM计算结果进行图形化显示。
3楼2012-03-28 12:27:52
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
亍寞: 金币+6 2012-03-28 19:56:17
亍寞: 金币+2 2012-03-29 09:24:31
AIM2000操作方便,可直接图形化显示结果,但是速度颇慢(尤其是盆积分),且不支持并行,而且收费,也没Linux版。而且不够灵活,比如没法自行删减、修改临界点,没法导出键径坐标等。

AIMALL在积分速度和精度上明显优于AIM2000,但是没有直观的交互式操作的界面,输出文件比较繁杂,图形化模块还是收费的。输入文件方面,AIMALL不仅支持wfn文件还支持fch文件,也支持Gaussian09 B.01开始引入的wfx文件(在赝势计算时可以将内核电子正确表现出来)

Multiwfn在搜索临界点和生成键径方面和AIM2000用法很类似,也是很方便的交互式操作,在一般四核机子上速度比AIM2000快一两个数量级,结果可直接图形化显示。所有结果都可以方便地导出、导入、修改。Multiwfn免费、开源,同时有Linux版。Multiwfn像AIMALL一样支持fch、wfn、wfx三种文件用于AIM分析。目前Multiwfn还不支持盆积分(未来会加入),如果不需要盆积分的话Multiwfn是比AIM2000和AIMALL明显更好的选择。
4楼2012-03-28 14:43:28
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亍寞

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-28 14:43:28:
AIM2000操作方便,可直接图形化显示结果,但是速度颇慢(尤其是盆积分),且不支持并行,而且收费,也没Linux版。而且不够灵活,比如没法自行删减、修改临界点,没法导出键径坐标等。

AIMALL在积分速度和精度上 ...

谢谢指点~multiwfn的确很好用,之前中的两篇文章都引用了您的程序...但是有一点不知道是我没有搞清楚使用方法还是什么,对于一些平面的分子,做出来的图很漂亮,但是有的时候立体分子,或者是想稍微调节一下图形的角度时候,比较困难......不知道这个是否会有解决方案?
5楼2012-03-28 19:59:07
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2012-03-30 17:17:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by 亍寞 at 2012-03-28 19:59:07:
谢谢指点~multiwfn的确很好用,之前中的两篇文章都引用了您的程序...但是有一点不知道是我没有搞清楚使用方法还是什么,对于一些平面的分子,做出来的图很漂亮,但是有的时候立体分子,或者是想稍微调节一下图形 ...

非平面分子通常以体系内三个原子坐标的方式来定义平面,或者指定三个坐标点来定义平面。对于后者,为了获得坐标点,可以利用其它可视化工具作为辅助,比如可以在gview里在适当位置增加一个辅助原子,然后将原子的坐标输入进Multiwfn里即可。
6楼2012-03-28 21:11:44
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亍寞

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-28 21:11:44:
非平面分子通常以体系内三个原子坐标的方式来定义平面,或者指定三个坐标点来定义平面。对于后者,为了获得坐标点,可以利用其它可视化工具作为辅助,比如可以在gview里在适当位置增加一个辅助原子,然后将原子的 ...

谢谢!
7楼2012-03-29 09:24:20
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1maomao

金虫 (初入文坛)

AIMALL计算确实很快,比较机械化,我用的时候,计算原子的性质的时候出现过个别分子被程序识别不出来,原子性质也就没算出来,还得拿AIM2000算。两个程序各有长处。
8楼2012-04-01 09:02:58
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亍寞

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 1maomao at 2012-04-01 09:02:58:
AIMALL计算确实很快,比较机械化,我用的时候,计算原子的性质的时候出现过个别分子被程序识别不出来,原子性质也就没算出来,还得拿AIM2000算。两个程序各有长处。

谢谢回复~大概是哪些分子不能被识别呢?原因是什么您知道么?
9楼2012-04-04 16:53:51
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1maomao

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 亍寞 at 2012-04-04 16:53:51:
谢谢回复~大概是哪些分子不能被识别呢?原因是什么您知道么?

我刚开始学,对程序还不太了解,只是我在算苯环的π键和其他分子之间的卤键的时候,与卤原子相连的两个C原子的原子性质识别不出来。具体原因我也不知道。
10楼2012-04-06 09:03:54
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