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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 遗传距离，亲缘关系
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

[求助] 遗传距离，亲缘关系

线粒体d-loop序列的遗传距离有多能说明种间的亲缘关系呢？多大怎样才可以说明两种群亲缘关系很近呢？
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1楼 2012-03-27 21:41:58
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
恶魔眼球: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-03-28 10:04:00
西瓜: 金币+4, 辛苦~ 2012-03-28 10:46:03
遗传距离只是表明亲缘关系的一种方法，D-loop虽然是常用标记，当其序列偏短，而且高变，对于分子钟的假设并不是很支持。还是建议筛选多个标记，将其Fst、进化树、单倍型等指标共同进行分析。
亲缘关系的远近都是相对的，只能根据你的研究问题来考虑。祝好
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将相本无种★男儿当自强
2楼2012-03-28 08:43:42
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-28 08:43:42:
遗传距离只是表明亲缘关系的一种方法，D-loop虽然是常用标记，当其序列偏短，而且高变，对于分子钟的假设并不是很支持。还是建议筛选多个标记，将其Fst、进化树、单倍型等指标共同进行分析。
亲缘关系的远近都是 ...

但是文献里说D-Loop环是整个线粒体基因组序列和长度变异最大的区域，就因为其进化速度最快，一般用于种内种群间的系统研究。您说的，对分子钟的假设不是很支持具体是指什么呢？
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3楼2012-03-28 10:50:11
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+2, 很热心哦 2012-03-28 15:09:04
恶魔眼球: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-03-28 20:35:27
进化速度快和高变异进本可以等同，用如此高进化速率的位点进行系统进化研究多用于种下的分析，D-Loop我也做过，没有想象的那么好用。至今我看到的鸟类方面的分子钟研究多集中于Cytb和SSR中，既然研究进化历程，当然要分析分化时间，没有分子钟的假设，很难进行估计（除非有很严谨的地理时间和化石校正）。
不知道你的研究方向为何，要解决什么问题，所以只能给出这样的回答，见谅。祝好。
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将相本无种★男儿当自强
4楼2012-03-28 14:55:09
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-28 14:55:09:
进化速度快和高变异进本可以等同，用如此高进化速率的位点进行系统进化研究多用于种下的分析，D-Loop我也做过，没有想象的那么好用。至今我看到的鸟类方面的分子钟研究多集中于Cytb和SSR中，既然研究进化历程，当 ...

我是要研究某个种群与其他种群的亲缘关系~你回答得很详细，谢谢了~
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5楼2012-03-28 20:35:07
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bluerain3

新虫 (初入文坛)
我也是要研究某个种内不同种群的亲缘关系，推测种内进化方式，和楼主大概是差不多的方向吧我猜。我也是苦于找不到合适的序列啊。。。。。。。祝楼主好运噻~~~
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6楼2013-06-25 11:03:09
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by bluerain3 at 2013-06-25 11:03:09
我也是要研究某个种内不同种群的亲缘关系，推测种内进化方式，和楼主大概是差不多的方向吧我猜。我也是苦于找不到合适的序列啊。。。。。。。祝楼主好运噻~~~

楼主已经顺利毕业了~~祝你也好运~~
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7楼2013-06-26 10:00:42
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