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碎瓣cpu

木虫 (正式写手)

[求助] 急！！！！液质图谱超诡异~~~不知道是不是被污染了 ~~~求高手帮忙看一下

急！！！

本人做的液质ESI-HRMS，样品是组织匀浆，冷冻干燥甲醇提取后,4000r/min离心15min

后，上清液进的HPLC-HRMS,正离子模式，结果出来的图谱是这样的，好像在整个背景

都是105.0402和121.0504,146.0683的离子。负离子模式比这个还糟糕。。。。。。。


是不是质谱被污染了？？？是不是离心转速不够大，需要10000r吗？
如果质谱被污染了要怎么呀？求高手支招，万分感谢！！！[ Last edited by 碎瓣cpu on 2012-3-26 at 17:34 ]
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fighting
1楼 2012-03-26 16:57:09
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

mc0326

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
碎瓣cpu: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢你的帮助 2012-03-29 16:32:29
楼主是一级质谱还是二级质谱？
如果是要测特定的化合物，为什么要用全扫呢，如果是一级就应该用SIM模式，二级用MRM模式啊。比如要测m/z 105的样品，就设置扫面范围为104.5-105.5。MRM模式要先优化方法选定子离子和CE值DP值什么的。
如果是想确定化合物分子量，也应该用标准品全扫啊，怎么会用组织样品呢？楼主分析方法到底确定好没有呢？
还有，楼主要测得m/z 都比较小，在不在质谱的离子扫描范围内，有些质谱要设置一下扫描范围偏好的。
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14楼2012-03-29 09:34:06
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guevara1967

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
碎瓣cpu: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢啦 2012-03-26 22:22:47
豆哥: 金币+1, 谢谢参与交流 2012-03-27 10:10:13
液质可能的污染来源
105                (2M+Na)+        acetonitrile
146                (3M+Na)+        acetonitrile
120                (M+Na+CH3CN)+        DMSO
122                (M+H)+        Tris
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梦想、激情、灵感、体验--che
5楼2012-03-26 22:16:53
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liuzhaomin

金虫 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 碎瓣cpu at 2012-03-28 16:23:48:
我检测的是里面的脂肪酸化合物，但要检测里面的所有脂肪酸  那你上面说的MRM模式是ms-ms吗？ 我们实验室的不是多级质谱

要检测的脂肪酸是内源性的是么？知道这些脂肪酸的分子量么？
如果是单级质谱，那么就不能用MRM模式了。
高分辨率仪器，可以选择检测成分的精确分子量，在全扫描图谱里面提取响应的分子离子峰（可能会有其他的加钠离子或钾离子等加合离子）
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13楼2012-03-28 17:02:26
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mc0326

金虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 碎瓣cpu at 2012-03-29 16:32:12:
我用是一级质谱，我的想知道的是所有化合物的分子量，看看肿瘤组与正常组的差别在那几个化合物上。然后鉴定一下这些有差别的化合物的结构 。所以，才定了100-2000的扫描范围。问一下，你们平时离心用多大转速，离 ...

你测定的不会是内源性化合物吧，有标准品吗？不会是做代谢组学的吧？你用的是TOF吗？
看你想鉴定结构，应该是对化合物信息有一些了解的吧，可以估计一下可能存在的化合物的分子量，再去谱图里找。这样直接对图谱还是很困难的。
我们一般沉淀蛋白离心6000g，10min。组织里面的杂质本身就很多，靠离心是去除不了多少的。如果想多去除杂质，可以考虑固相萃取什么的，但是可能会造成未知化合物的损失，看你的目的是什么了。
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18楼2012-03-30 15:08:25
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普通回帖

xyz8538

木虫 (著名写手)
感谢参与，应助指数 +1
豆哥: 应助指数-1, 违规存档, 不是应助，指数取消，警告一次 2012-03-26 22:05:53
哇塞 ，这么多峰 啊……
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2楼2012-03-26 17:52:52
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碎瓣cpu

木虫 (正式写手)
哎  没人来看那   自己顶一个
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fighting
3楼2012-03-26 19:18:10
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xy5440110

铁虫 (小有名气)
....山峰好高
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4楼2012-03-26 21:44:08
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碎瓣cpu

木虫 (正式写手)
哎  难道没有人做这个啊？？？？
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fighting
6楼2012-03-27 17:41:28
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liuzhaomin

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-03-27 19:06:17
碎瓣cpu: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-03-28 09:08:14
碎瓣cpu: 金币+3, 谢谢你帮助 2012-03-29 16:15:44
排除仪器的污染，可以用你处理样品的甲醇进一针，同样条件下检测，看是否有这些峰，感觉如果你是高分辨率的仪器，有可能会出很多峰，因为肿瘤匀浆，说白了有好多蛋白或者肽类，也会有信号响应。
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7楼2012-03-27 18:57:01
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liuzhaomin

金虫 (著名写手)
★
xiaoxiao270: 金币+1, 3Q 2012-03-27 19:06:23
补充一句：特别是在全扫描的情况下，出很多峰的情况很常见，如果是检测某种化合物的话，最好是MRM模式检测。
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8楼2012-03-27 18:58:33
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碎瓣cpu

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuzhaomin at 2012-03-27 18:57:01:
排除仪器的污染，可以用你处理样品的甲醇进一针，同样条件下检测，看是否有这些峰，感觉如果你是高分辨率的仪器，有可能会出很多峰，因为肿瘤匀浆，说白了有好多蛋白或者肽类，也会有信号响应。

我用的是乙腈  之前有一段时间测定的时候，就是冲柱子的时候，整个背景都是像梳子一样的 搞的我好郁闷
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fighting
9楼2012-03-28 09:12:31
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碎瓣cpu

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by liuzhaomin at 2012-03-27 18:58:33:
补充一句：特别是在全扫描的情况下，出很多峰的情况很常见，如果是检测某种化合物的话，最好是MRM模式检测。

我是菜鸟 MRM是什么模式  我只用过正负离子模式  我扫描的是M/Z 100-2000的范围。样品我是用甲醇处理的，里面大分子蛋白质应该基本没有吧？  像现在这种情况，要怎么才能解决啊？
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fighting
10楼2012-03-28 09:17:00
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