| 查看: 1215 | 回复: 0 | ||
castlered木虫 (小有名气)
|
[求助]
求助ncbi序列提交问题
|
|
前几天提交了几个细菌的基因簇序列，收到如下回信： We have noticed that some or all of the sequences contain internal stop >codons and/or reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST >similarity search results and/or an alignment). This generally indicates problems such as: > > - errors in the nucleotide sequence > - problems with feature annotation which may be due to: > translation in the wrong reading frame or on the wrong strand > translation does not have the correct exon spans > translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's > - sequence may be a pseudogene > >If the sequences and/or annotation are incorrect, please resubmit >with the corrected files. If the information is correct, please explain >the presence of the internal stop codons and/or frame shifts. > >If you are unable to determine the correct sequence and/or annotation >for your sequence(s), they can still be processed and the following >comment will be added to your records: > >COMMENT GenBank staff is unable to verify sequence and/or annotation > provided by the submitter. > >In addition, the record(s) will indicate that the data are unverified and >your sequence(s) will not be included in NCBI BLAST databases. > >Please either: > > [1] resubmit with correct sequence(s) and/or annotation > or > [2] confirm that your sequence(s) should be processed as unverified. 我的序列都是用artemis进行的预测，ncbi上blast注释的，应该没有内部的终止密码子出现的，移码突变这个倒是有可能出现，但我一共提交了10个序列，每个都十几个orf呢，怎么快速检查解决这种状况呢？非常感谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
93BebMhtakh前后11位开头都是大写
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有86人回复
-
感觉是下周放榜了
已经有11人回复
-
filecode=后面第一个是大写字母
已经有10人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有4人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有15人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有9人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
菜鸟求助——着急求助解答：在NCBI上为什么下载不了FASTA格式的基因序列
已经有9人回复
- 向NCBI提交序列问题
已经有8人回复
- 如何在ncbi上提交序列获得序列登记号
已经有5人回复
- 【求助/交流】NCBI序列问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】我做了SSH，测序了400个。反转录序列与NCBI比对还用将其反向吗
已经有3人回复
- 【求助/交流】NCBI上注册基因序列，没有ACCESSION NUMEBER是怎么回事？谢谢
已经有6人回复
- 【求助/交流】NCBI给了我登录号但是用号查不到，这样算不算登录成功呢？
已经有8人回复
- 【求助/交流】向NCBI提交序列后编辑的回信，大家帮忙看下
已经有3人回复
- 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
已经有17人回复
- 【求助/交流】有人懂NCBI在线序列提交吗？
已经有4人回复
- 【求助/交流】请教一个NCBI上注释的问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】如果发现上传NCBI序列有问题 要如何申请撤销或修改
已经有5人回复
- 【求助/交流】请问，有没有谁知道，如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列？
已经有13人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
