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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS 动力学计算 步数设置
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江xiao鱼

铁虫 (小有名气)

[求助] MS 动力学计算 步数设置

请教大家：动力学计算时，是不是设置的步数越多结果越准确呢？一般设置多少比较合适？
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Persistence is the victory！！
1楼 2012-03-23 09:54:51
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-03-24 22:39:31
引用回帖:
6楼: Originally posted by 江xiao鱼 at 2012-03-24 09:05:41:
我做的是水溶液体系，开始设置的跑100ps,分析结果很正常。然后增大体系，再跑100ps的时候再分析，就出现“溢出”的情况。请问，这个“溢出”是步数少造成的吗？

溢出可能是内存不够用造成的，应该不是步数少的问题吧
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壁立万仞，无欲则刚
7楼2012-03-24 12:42:58
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-03-24 09:16:44
1000到2000ps就差不多了
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有问题可以私下里探讨，1986319688@qq.com
2楼2012-03-23 09:59:44
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beanundersky

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-03-23 09:59:44:
1000到2000ps就差不多了

需要这么长吗？见到过几百ps的~
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化朽为奇，工石为玉
3楼2012-03-23 10:09:40
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z: 金币+1, 鼓励交流 2012-03-23 12:40:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by beanundersky at 2012-03-23 10:09:40:
需要这么长吗？见到过几百ps的~

看你跑什么东西了，因为要计算分析的东西一般要多次取平均的，还有后100ps不稳定的是要去掉不能用的
赞一下 回复此楼
有问题可以私下里探讨，1986319688@qq.com
4楼2012-03-23 11:14:43
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