| 查看: 2953 | 回复: 6 | ||||
| 【奖励】 本帖被评价5次，作者ter20增加金币 4 个 | ||||
[资源]
通过电子密度和静电势两个cube文件直接在GV中做静电势图
|
||||
|
看到板上有一篇通过fchk文件在GV中做静电势图的文章“分子的静电势的物理意义与图形表达”：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1091031。但是经常我们遇到的分子比较大时，通过GV产生密度时速度会很慢，所以这里我分享一下我的做法。 1. 在服务器上通过cubegen命令对fchk文件操作，产生电子密度和静电势的两个cube文件，e.g.， cubegen 0 density test.fchk Density.cube 0 h cubegen 0 potential test.fchk Potential.cube 0 h 2. 用GV打开Potential.cube -- Cube Actions -- Load Cube （载入Density.cube）-- Surface Actions -- New Mapped Surface -- 确定即可 不知道有没有朋友已经发过了，这里只是分享一下，希望能够对大家有所帮助。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 lywiailyw | 作图 |
» 猜你喜欢
Tc数据拟合
已经有1人回复
-
寻求物理化学学报最新的投稿模板！
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有118人回复
-
韩国釜山大学储能电池与功能材料实验室诚招博后（电池/电化学/器件制备/MOF合成）
已经有187人回复
-
祈福！
已经有79人回复
-
投稿咨询
已经有7人回复
-
自科面上 散金币 祈福
已经有61人回复
-
散金求好运
已经有315人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子表面静电势图
已经有5人回复
- 计算分子的轨道，密度和静电势
已经有4人回复
- 做电子密度差图时如何选择差分对象并进行分析？
已经有7人回复
- GaussianView画ESP图问题
已经有4人回复
- 关于静电势差分图的问题
已经有19人回复
- 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
已经有14人回复
- 如何计算静电势ESP以及作图
已经有12人回复
- VASP5.2算出的静电势很低
已经有7人回复
- 静电势为什么有正负值？
已经有102人回复
- 这个图是用哪个软件做出来的
已经有4人回复
- 谈谈Molekel做静电势填色等值面图的方法及误区
已经有50人回复
- 【小卒个人文集】写给初学者:小议形式电荷对量化初学者的误导
已经有27人回复
- 【讨论】关于静电势图的描述
已经有11人回复
- 【求助】Molecular electrostatic potential (MEP) maps 分子静电势怎样计算？
已经有22人回复
- 【原创】分子的静电势的物理意义与图形表达
已经有408人回复
2楼2012-03-21 17:50:10
3楼2012-12-07 21:56:55
6楼2014-09-11 15:31:45
7楼2014-09-20 15:25:05
简单回复
阡陌蔓4楼
2013-04-20 16:12
回复
五星好评 
Quan.5楼
2013-04-23 06:49
回复
五星好评 谢谢分享！！！！！！！！！！
20