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通过电子密度和静电势两个cube文件直接在GV中做静电势图
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看到板上有一篇通过fchk文件在GV中做静电势图的文章“分子的静电势的物理意义与图形表达”：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1091031。但是经常我们遇到的分子比较大时，通过GV产生密度时速度会很慢，所以这里我分享一下我的做法。 1. 在服务器上通过cubegen命令对fchk文件操作，产生电子密度和静电势的两个cube文件，e.g.， cubegen 0 density test.fchk Density.cube 0 h cubegen 0 potential test.fchk Potential.cube 0 h 2. 用GV打开Potential.cube -- Cube Actions -- Load Cube （载入Density.cube）-- Surface Actions -- New Mapped Surface -- 确定即可 不知道有没有朋友已经发过了，这里只是分享一下，希望能够对大家有所帮助。 |
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 lywiailyw | 作图 |
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Quan.5楼
2013-04-23 06:49
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