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微笑生活

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问怎样通过生物信息学的方法确定一个基因有几个拷贝

有基因组数据，也有这个基因的序列，怎样通过生物信息学的方法确定一个基因有几个拷贝？请指教，谢谢！
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1楼 2012-03-18 16:41:59
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320080920001

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
看天: 金币+2, 鼓励交流 2012-03-19 00:02:35
请问几个拷贝是指这个基因在染色体中有多少个吗？那我觉得直接在NCBI或者UCSC中搜这个基因的名字就能显示吧
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2楼2012-03-18 23:32:48
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xuzoda

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
telomerase: 金币+1, 欢迎多多交流！ 要是能把文献发上来就更好了！ 2012-03-20 09:06:11
应该是根据几个序列比对的相似程度吧，你可以参考这篇文献whole-genome survey and characterization of MADS-box gene family in maize and sorghum,这里面有比对的原则
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3楼2012-03-19 21:35:05
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wanggl2004

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
荧光定量pcr的绝对定量可以实现的，就是要找好内参基因，内参基因有确定的拷贝数！
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思考是行动的种子！
4楼2012-03-20 09:06:56
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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这很容易吧，做个blast不就行了吗？
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科学永无止境,只有合作共享才能更好地……
5楼2012-03-21 18:44:53
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wocooo

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

有resequence的数据吗
可以用软件做CNV分析的
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6楼2013-01-28 23:19:35
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