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请问怎样通过生物信息学的方法确定一个基因有几个拷贝
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微笑生活
铜虫
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专业: 生物信息学
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请问怎样通过生物信息学的方法确定一个基因有几个拷贝
有基因组数据,也有这个基因的序列,怎样通过生物信息学的方法确定一个基因有几个拷贝?请指教,谢谢!
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2012-03-18 16:41:59
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专业: 免疫生物学
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看天: 金币+2, 鼓励交流
2012-03-19 00:02:35
请问几个拷贝是指这个基因在染色体中有多少个吗?那我觉得直接在NCBI或者UCSC中搜这个基因的名字就能显示吧
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2012-03-18 23:32:48
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xuzoda
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专业: 植物遗传学
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telomerase: 金币+1, 欢迎多多交流! 要是能把文献发上来就更好了!
2012-03-20 09:06:11
应该是根据几个序列比对的相似程度吧,你可以参考这篇文献whole-genome survey and characterization of MADS-box gene family in maize and sorghum,这里面有比对的原则
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3楼
2012-03-19 21:35:05
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wanggl2004
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专业: 微生物资源与分类学
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荧光定量pcr的绝对定量可以实现的,就是要找好内参基因,内参基因有确定的拷贝数!
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思考是行动的种子!
4楼
2012-03-20 09:06:56
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dehong1573
至尊木虫
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专业: 病原细菌与放线菌生物学
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这很容易吧,做个blast不就行了吗?
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科学永无止境,只有合作共享才能更好地……
5楼
2012-03-21 18:44:53
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wocooo
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专业: 遗传学研究新技术与方法
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有resequence的数据吗
可以用软件做CNV分析的
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6楼
2013-01-28 23:19:35
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