| 查看: 4394 | 回复: 11 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
cfmzxf84木虫 (正式写手)
|
[求助]
求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
|
|
|
求助，我想用DS同源建模，已有多个PDB模板可以用，请教怎么操作呢？ 网上的教程基本上都是需要n95，或者90数据库，从网上download结构。 我有自己的模版，因此改变了一些步骤来做，但是一直不成功，求指导。谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有9人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有12人回复
12楼2012-05-21 10:19:59
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-17 19:49:58
cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-03-18 00:16:03
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-17 19:49:58
cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-03-18 00:16:03
|
首先把你要建模的目标序列编译成fasta文件 然后打开编好的fasta文件接着打开你要当做模板的pdb文件 接下来在protocol里找到align sequence to template模块，分别放入你的序列文件和pdb文件，修改相应参数 计算完成后打开运行结果然后运行build homology modle放入相应的文件进行运算就ok了。 |
2楼2012-03-17 19:43:10
cfmzxf84
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 5003.4
- 散金: 822
- 红花: 1
- 帖子: 908
- 在线: 328.6小时
- 虫号: 814536
- 注册: 2009-07-23
- 专业: 化学环境污染与健康
3楼2012-03-18 00:17:52
4楼2012-03-18 08:10:05
25