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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 交流：水上加氢原子精修讨论
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
20楼: Originally posted by 心蕊rxr at 2013-03-08 17:37:19
可是加过dfix 0.84 O1 H1a O1 H1b    dfix 1.46 H1a H1b 命令后，为什么O-H键的键长没有发生改变呢

首先谢谢你的问题。请问你可以把这样结构的实例发给我一份吗？O-H键的键长没有发生改变的可能原因是H1a 和 H1b的电子云密度比较大，这个时候使用DFIX命令搬动这2个氢原子一般会使得数据变坏，H1a 和 H1b的位置变得不够稳定。看起来还是要具体问题具体分析，再采取别的办法来解决问题。
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老歪博
21楼2013-03-10 18:33:30
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qiqing7777

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果利用Q峰的方法找不到水上的氢怎么办~我都是出一百个Q峰，修了好多轮 可还是找不到Q峰，还有别的方法么~
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22楼2013-03-12 09:41:53
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yh1311987

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
学习了，谢谢分享经验，最近一直在为加氢头疼。
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23楼2013-03-12 10:36:54
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
22楼: Originally posted by qiqing7777 at 2013-03-12 09:41:53
如果利用Q峰的方法找不到水上的氢怎么办~我都是出一百个Q峰，修了好多轮 可还是找不到Q峰，还有别的方法么~

试一试二百个Q或者更多个Q峰呢，总会找到合适的，尽管意义不大。
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老歪博
24楼2013-03-12 15:58:44
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qiqing7777

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问老师，这个问题：
DFIX 0.85 0.01 O1W H1WA
DFIX 0.85 0.01 O1W H1WB
DFIX 0.85 0.01 O2W H2WA
DFIX 0.85 0.01 O2W H2WB
DFIX 0.85 0.01 O3W H3WA
DFIX 0.85 0.01 O3W H3WB
DFIX 0.85 0.01 O4W H4WA
DFIX 0.85 0.01 O4W H4WB
DFIX 1.39 0.01 H1WA H1WB  
DFIX 1.39 0.01 H2WA H2WB   
DFIX 1.39 0.01 H3WA H3WB   
DFIX 1.39 0.01 H4WA H4WB
我把四个水都DIFX了，可是CHECK还是说：
PLAT355_ALERT_3_A Long    O-H Bond (0.82A)   O2W    -   H2WB   ...       1.18 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H4WB   ..  H4WB    ..       1.62 Ang.
小生表示哪里错了
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25楼2013-04-04 16:52:27
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
25楼: Originally posted by qiqing7777 at 2013-04-04 16:52:27
请问老师，这个问题：
DFIX 0.85 0.01 O1W H1WA
DFIX 0.85 0.01 O1W H1WB
DFIX 0.85 0.01 O2W H2WA
DFIX 0.85 0.01 O2W H2WB
DFIX 0.85 0.01 O3W H3WA
DFIX 0.85 0.01 O3W H3WB
DFIX 0.85 0.01 O4W H4 ...

PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H4WB   ..  H4WB    ..       1.62 Ang.
这个问题说明这个氢原子的位置不对。你可以删掉H4WB重新找合适的q峰。
PLAT355_ALERT_3_A Long    O-H Bond (0.82A)   O2W    -   H2WB   ...       1.18 Ang.
这个问题也有可能是上头的原因，也可能不是。所以一种方法你可以在DFIX命令中降低0.85数值，进行精修，关键是要O2W    -   H2WB   ...       1.18 Ang. 中的1.18收敛到接近0.82，这才是你的目的。
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qiqing7777
老歪博
26楼2013-04-04 17:40:56
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happypanda

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
27楼2013-04-04 17:52:22
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
27楼: Originally posted by happypanda at 2013-04-04 17:52:22
请问遇到这种情况采用什么办法呢？...

办法就是继续寻找合适的q峰来代替原先的H1a 和 H1b。
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老歪博
28楼2013-04-04 18:21:05
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qiqing7777

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
26楼: Originally posted by p452_1 at 2013-04-04 17:40:56
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H4WB   ..  H4WB    ..       1.62 Ang.
这个问题说明这个氢原子的位置不对。你可以删掉H4WB重新找合适的q峰。
PLAT355_ALERT_3_A Long    O-H Bond (0.82A)   O2 ...

谢谢，解决了~
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29楼2013-04-06 11:02:00
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jia456789

木虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
学习了 以后有机会实践一下
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30楼2013-04-08 15:05:12
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