| 查看: 815 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Abinit 建模疑问 已有1人参与
|
|||
|
初始学习Abinit建模，使用在论坛里面其他人的经验帖来建模，还是有很多疑问。请熟悉的老师和同学来解答一下。 我想构建一个单斜的A2BCO6的晶体结构，已经确认是单胞。把参数输入MS后导出的cif文件如下， data_111 _audit_creation_date _audit_creation_method 'Materials Studio' _symmetry_space_group_name_H-M 'P21/C' _symmetry_Int_Tables_number 14 _symmetry_cell_setting monoclinic loop_ _symmetry_equiv_pos_as_xyz x,y,z -x,y+1/2,-z+1/2 -x,-y,-z x,-y+1/2,z+1/2 _cell_length_a 7.5400 _cell_length_b 5.5180 _cell_length_c 9.2014 _cell_angle_alpha 90.0000 _cell_angle_beta 145.0284 _cell_angle_gamma 90.0000 loop_ _atom_site_label _atom_site_type_symbol _atom_site_fract_x _atom_site_fract_y _atom_site_fract_z _atom_site_U_iso_or_equiv _atom_site_adp_type _atom_site_occupancy O1 -0.63500 0.30700 -0.19300 0.00000 Uiso 1.00 O2 0.74900 0.19300 0.30700 0.00000 Uiso 1.00 A -0.73100 0.06800 -0.48100 0.00000 Uiso 1.00 O3 0.13900 0.46100 0.38900 0.00000 Uiso 1.00 B -0.00000 0.50000 0.50000 0.00000 Uiso 1.00 C -0.50000 0.00000 -0.00000 0.00000 Uiso 1.00 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1303613 这个帖子里面提到的用这种方法建模，提取 a b c 角度 原子坐标即可建模，由于下面要涉及到计算磁性，需要对B和C原子的自旋进行设定，所以有一个疑问，设定自旋的时候只设定B和C两个原子的有磁矩吗？如果我想设定更丰富的磁结构，比如B的次格子内部还有反铁磁的排列，这样建模是不是就不行了？ 同时我对同一个MS建的模型，后也取了.cell文件，发现如下： %BLOCK LATTICE_CART -0.000000000000001 0.000000000000001 7.540000000000000 0.000000000000000 5.517999999999999 0.000000000000000 -5.274000000000000 0.000000000000000 -7.540000000000001 %ENDBLOCK LATTICE_CART %BLOCK POSITIONS_FRAC O -0.6349999999999999 0.3070000000000002 -0.1929999999999999 O 0.7489999999999998 0.1930000000000000 0.3069999999999997 O 0.1389999999999998 0.4609999999999999 0.3889999999999998 O 0.6349999999999998 0.8070000000000002 0.6929999999999998 O -0.7489999999999999 0.6930000000000001 0.1930000000000003 O -0.1389999999999999 0.9610000000000000 0.1110000000000001 O 0.6349999999999998 -0.3070000000000002 0.1929999999999998 O -0.7489999999999999 -0.1930000000000000 -0.3069999999999997 O -0.1389999999999999 -0.4610000000000000 -0.3889999999999999 O -0.6349999999999999 0.1929999999999998 0.3070000000000001 O 0.7489999999999999 0.3070000000000001 0.8069999999999997 O 0.1389999999999999 0.0390000000000001 0.8889999999999998 C -0.0000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000 C -0.0000000000000000 1.0000000000000000 -0.0000000000000000 B -0.5000000000000000 -0.0000000000000000 -0.0000000000000000 B 0.4999999999999999 0.5000000000000000 0.5000000000000000 A -0.7310000000000000 0.0680000000000001 -0.4809999999999999 A 0.7310000000000000 0.5680000000000002 0.9809999999999999 A 0.7310000000000000 -0.0680000000000001 0.4809999999999999 A -0.7310000000000000 0.4319999999999999 0.0190000000000001 %ENDBLOCK POSITIONS_FRAC 对比发现，同样的结构，在.cell文件中原子达到20个，这我能理解，应该是对称性操作后照成的，但是“%BLOCK LATTICE_CART” 一项应该怎么和 cif中的a b c 相对应呢？它们之间有什么关系呢？是不是rprim？该怎么求出rprim？ |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
基金不中，共勉
已经有5人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有3人回复
-
我不理解！
已经有23人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有10人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- ABINIT又出新版6.10.1！！！
已经有13人回复
- abinit中赝势的含义
已经有22人回复
- abinit 建模无解~~~ 求助！！
已经有16人回复
- abinit能否处理一个位置被两种元素占据的固溶体的能带和态密度
已经有10人回复
- 【求助】编译Abinit6.4.1出错
已经有5人回复
- 【求助】为什么abinit-6.2.3 tutorial 里面的lesson3运行不了?
已经有7人回复
- 【求助】求助：安装abinit-6.2.3出现错误
已经有12人回复
- 【求助完毕】Abinit 6.2.3安装出错
已经有7人回复
- 【求助】ABINIT中的建模问题
已经有26人回复
- 【原创】ABINIT的一种晶体结构建模方法
已经有26人回复
- 【求助】Abinit的自带教程怎么有问题那？
已经有7人回复
3楼2012-03-16 17:03:06
sars518
木虫 (著名写手)
小木虫灌水大队队长
- 1ST强帖: 6
- 应助: 29 (小学生)
- 贵宾: 0.119
- 金币: 3365.2
- 散金: 4434
- 红花: 32
- 帖子: 2641
- 在线: 2213.2小时
- 虫号: 539209
- 注册: 2008-04-03
- 性别: GG
- 专业: 科学社会主义
2楼2012-03-16 16:40:19
投票:
