24小时热门版块排行榜    

查看: 1908  |  回复: 12

songxiao60

银虫 (小有名气)

[求助] 求教 4,4’-联吡啶 环中无序的处理

晶体结晶与 C2/M 空间群 ,其中 4,4’-联吡啶 中有两个C 无序, grow后 总是相应出现在另外两个位置的,,而与之对应的边上的两个C 不是无序。从而 导致整个环扭曲的很厉害。求教如何做好无序,以便换 堆积图。

[ Last edited by songxiao60 on 2012-3-15 at 10:49 ]
回复此楼
荣辱不惊,闲看庭前花开花落;去留无意,漫随天外云卷云舒!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用platon升一下空间群,通常能够解决。
2楼2012-03-15 11:37:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxiao60

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mashulin at 2012-03-15 11:37:19:
用platon升一下空间群,通常能够解决。

platon 显示空间群是对的 。不能在转了呀 。
荣辱不惊,闲看庭前花开花落;去留无意,漫随天外云卷云舒!
3楼2012-03-15 12:53:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


huangjr: 金币+1, 感谢热心帮助~ 2012-03-18 15:18:37
用omit删除坏点后进一步精修。
4楼2012-03-15 12:56:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

r2rr2r

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢热心帮助~ 2012-03-18 15:18:53
将对应两个C强行劈分,修几轮后用flat或者afix 66命令限制环平面。一般可以解决。
5楼2012-03-16 11:10:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxiao60

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mashulin at 2012-03-15 12:56:32:
用omit删除坏点后进一步精修。

这个结构的数据还是不错的 ,但是的出来的 吡啶环扭曲的很厉害 ,有篇类似结构的文献 上 测了三个不同的温度,三个结构的 吡啶环都是扭曲的。 但是他最后做的图确看不出来扭曲。
荣辱不惊,闲看庭前花开花落;去留无意,漫随天外云卷云舒!
6楼2012-03-16 11:30:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxiao60

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by r2rr2r at 2012-03-16 11:10:49:
将对应两个C强行劈分,修几轮后用flat或者afix 66命令限制环平面。一般可以解决。

您的意思是没有无序的那两个C也劈分? 我试过了 ,但是 最后 无序的 都找不到在一个平面的 ,我用了 flat 一点反应都没有 ,照样无序啊。
荣辱不惊,闲看庭前花开花落;去留无意,漫随天外云卷云舒!
7楼2012-03-16 11:32:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

r2rr2r

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
songxiao60: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 很感谢您的帮助 ,辛苦了! 2012-03-20 16:42:10
是否可以把res文件发到r2r@sina.com看看实际情况?
8楼2012-03-16 12:42:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

etin

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢热心帮助~ 2012-03-18 15:19:17
可以固定平面,让他们不相对移动
淡定如风,坚毅如艾
9楼2012-03-17 10:24:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yulaoban

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 欢迎回帖交流~ 2012-03-18 15:19:40
个人觉得还是楼上那位说得,刚性基团的固定,一般是用AFIX把~ 不过共平面处理也可以用到Flat~(最少是四个原子)
在对的时间,遇见对的人,是一生幸福...
10楼2012-03-18 10:37:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 songxiao60 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +3 暗涌afhb 2026-03-16 3/150 2026-03-20 00:28 by 河南大学校友
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +6 墨墨漠 2026-03-18 6/300 2026-03-20 00:02 by 23Postgrad
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 一志愿北京化工大学0703化学318分,有科研经历,求调剂 +3 一瓶苯甲酸 2026-03-14 3/150 2026-03-19 15:17 by 尽舜尧1
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +11 yangfz 2026-03-17 11/550 2026-03-19 15:06 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 332求调剂 +3 ydfyh 2026-03-17 3/150 2026-03-19 10:14 by 功夫疯狂
[考研] 274求调剂 +6 S.H1 2026-03-18 6/300 2026-03-19 09:34 by 花店相见
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 化学工程321分求调剂 +15 大米饭! 2026-03-15 18/900 2026-03-18 14:52 by haxia
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗? 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
信息提示
请填处理意见