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songxiao60

银虫 (小有名气)

[求助] 求教 4,4’-联吡啶 环中无序的处理

晶体结晶与 C2/M 空间群 ,其中 4,4’-联吡啶 中有两个C 无序, grow后 总是相应出现在另外两个位置的,,而与之对应的边上的两个C 不是无序。从而 导致整个环扭曲的很厉害。求教如何做好无序,以便换 堆积图。

[ Last edited by songxiao60 on 2012-3-15 at 10:49 ]
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songxiao60

银虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by mashulin at 2012-03-15 11:37:19:
用platon升一下空间群,通常能够解决。

platon 显示空间群是对的 。不能在转了呀 。
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3楼2012-03-15 12:53:21
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songxiao60

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mashulin at 2012-03-15 12:56:32:
用omit删除坏点后进一步精修。

这个结构的数据还是不错的 ,但是的出来的 吡啶环扭曲的很厉害 ,有篇类似结构的文献 上 测了三个不同的温度,三个结构的 吡啶环都是扭曲的。 但是他最后做的图确看不出来扭曲。
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6楼2012-03-16 11:30:06
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songxiao60

银虫 (小有名气)

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5楼: Originally posted by r2rr2r at 2012-03-16 11:10:49:
将对应两个C强行劈分,修几轮后用flat或者afix 66命令限制环平面。一般可以解决。

您的意思是没有无序的那两个C也劈分? 我试过了 ,但是 最后 无序的 都找不到在一个平面的 ,我用了 flat 一点反应都没有 ,照样无序啊。
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7楼2012-03-16 11:32:20
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songxiao60

银虫 (小有名气)

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8楼: Originally posted by r2rr2r at 2012-03-16 12:42:54:
是否可以把res文件发到r2r@sina.com看看实际情况?

您好。我将 相应的res 发在您邮箱。很感谢您的热情相助!
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11楼2012-03-19 10:58:34
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songxiao60

银虫 (小有名气)

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9楼: Originally posted by etin at 2012-03-17 10:24:05:
可以固定平面,让他们不相对移动

我没有办法固定他,用了命令也没有反应。
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12楼2012-03-19 11:07:19
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