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过渡态搜索中反应物相关问题
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wangyoucheng
新虫
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虫号: 894806
[交流]
过渡态搜索中反应物相关问题
各位虫友好!
我在用MS进行过渡态搜索前需对反应物进行优化,若我的反应物或生成物是两种及以上物质,那这两种物质在一个3D文件里怎么放置,之间距离可以随便放吗,会不会影响最后计算结果。我看过只有一种物质的反应物和生成物的过渡态搜索,不知两种生成物或产物是否一样?
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1楼
2012-03-14 15:03:43
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hopedream
银虫
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虫号: 2557339
如果查不到文献数据,你必须尝试所有可能的结构,摆放的位置,根据能量最低原理来筛选,当然这必须是相同的物质,这样比较才有意义
发自小木虫Android客户端
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12楼
2017-02-15 07:36:27
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369793730
铜虫
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虫号: 1004475
★
wangyoucheng(金币+1): 谢谢参与
如果一开始不知道,哪么拉近点先产生类似范德华力的弱作用力,然后在寻找。
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2楼
2012-03-14 16:00:53
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wangyoucheng
新虫
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虫号: 894806
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
369793730
at 2012-03-14 16:00:53:
如果一开始不知道,哪么拉近点先产生类似范德华力的弱作用力,然后在寻找。
还是没看明白,产生类似范德华的弱作用力是啥意思呢?
我想知道的是这些分析怎么摆放合适,之间的距离有没有限制。
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3楼
2012-03-14 17:07:07
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寒心雪
铁虫
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虫号: 986448
★
wangyoucheng(金币+1): 谢谢参与
个人觉得2楼回答正解,但距离不是最大的问题,方向更重要一些。
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4楼
2012-04-18 10:10:54
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