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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)


[交流] 过渡态搜索中反应物相关问题

各位虫友好!
       我在用MS进行过渡态搜索前需对反应物进行优化,若我的反应物或生成物是两种及以上物质,那这两种物质在一个3D文件里怎么放置,之间距离可以随便放吗,会不会影响最后计算结果。我看过只有一种物质的反应物和生成物的过渡态搜索,不知两种生成物或产物是否一样?

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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 369793730 at 2012-03-14 16:00:53:
如果一开始不知道,哪么拉近点先产生类似范德华力的弱作用力,然后在寻找。

还是没看明白,产生类似范德华的弱作用力是啥意思呢?
我想知道的是这些分析怎么摆放合适,之间的距离有没有限制。
3楼2012-03-14 17:07:07
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369793730

铜虫 (小有名气)



wangyoucheng(金币+1): 谢谢参与
如果一开始不知道,哪么拉近点先产生类似范德华力的弱作用力,然后在寻找。
2楼2012-03-14 16:00:53
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寒心雪

铁虫 (小有名气)



wangyoucheng(金币+1): 谢谢参与
个人觉得2楼回答正解,但距离不是最大的问题,方向更重要一些。
4楼2012-04-18 10:10:54
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 寒心雪 at 2012-04-18 10:10:54:
个人觉得2楼回答正解,但距离不是最大的问题,方向更重要一些。

这个方向又怎么确定呢? 距离和方向怎么摆放才合适?有没有做过这方面的计算?
5楼2012-04-18 15:52:53
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