| 查看: 3876 | 回复: 10 | ||
[求助]
测试POSCAR的脚本不运行
|
|
初学VASP，为了拟合平衡晶格常数，看了侯柱锋老师的《VASP的软件包使用指南》2005-11-28，里面有一个脚本run_a0来拟合Volume-Etotal的数据，按步骤首先准备好INCAR，POTCAR，KPOINTS，POSCAR就用脚本run_a0的内容，最后用提交了任务，结果计算不能进行。我把run_a0脚本和计算结果都贴出来，请求高手指导一下！谢谢！ 脚本： #！/bin/sh rm WAVECAR for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30 do cat > POSCAR < Al-fcc $i 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.0 0.5 1 Direct 0.0 0.0 0.0 ! echo “a=$i angstrom”; time vasp E=’ grep “TOTEN” OUTCAR | tail -1| awk ‘{printf “ %12.6f \n”, $5}’’ V=’ grep “volume” OUTCAR | tail -1| awk ‘{printf “ %12.4f \n”, $5}’’ echo $V $E >>EtVo.dat done 计算结果： Sender: LSF System Subject: Job 17496: Job Job was executed on host(s) <12*blade084>, in queue was used as the home directory. was used as the working directory. Started at Thu Mar 8 16:35:59 2012 Results reported at Thu Mar 8 16:36:06 2012 Your job looked like: ------------------------------------------------------------ # LSBATCH: User input run ------------------------------------------------------------ Successfully completed. Resource usage summary: CPU time : 3.37 sec. Max Memory : 2 MB Max Swap : 24 MB Max Processes : 1 Max Threads : 1 The output (if any) follows: running on 24 nodes distr: one band on 1 nodes, 24 groups vasp.5.2.2 15Apr09 complex ERROR: there must be 1 or 3 items on line 2 of POSCAR Job /lsf1/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper /share/software/vasp/vasp5.2/vasp5.2_ifort12.1_mkl_impi4.0 TID HOST_NAME COMMAND_LINE STATUS TERMINATION_TIME ===== ========== ================ ======================= =================== 00000 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00001 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00002 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00003 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00004 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00005 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00006 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00007 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00008 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00009 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00010 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00011 blade086 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00012 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00013 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00014 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00015 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00016 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00017 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00018 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00019 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00020 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00021 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00022 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 00023 blade084 /share/software/ Done 03/08/2012 16:36:03 |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有8人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于VASP一些琐事的求助（K点，吸附优化等）
已经有12人回复
- calculating ideal strength of crystal using VASP
已经有77人回复
- 写了一个fortran90的小程序，编译通不过，请大侠帮忙
已经有59人回复
- VASP 截断能测试 急求
已经有8人回复
- 【求助】如何根据cell文件写poscar
已经有11人回复
- 【求助成功】晶格优化的结果很诡异
已经有13人回复
- 【求助】并行vasp出了问题
已经有7人回复
- 【求助】帮忙编个用于VASP小程序
已经有22人回复
- 【原创】将POSCAR转化为cif文件的一个脚本
已经有145人回复
- 【求助】新手求助！运行完vasp之后poscar文件没有重写
已经有4人回复
liliangfang
荣誉版主 (著名写手)
- 1ST强帖: 7
- 应助: 138 (高中生)
- 贵宾: 0.952
- 金币: 10648.7
- 散金: 4575
- 红花: 42
- 沙发: 3
- 帖子: 1856
- 在线: 825.2小时
- 虫号: 1275010
- 注册: 2011-04-23
- 性别: GG
- 专业: 微/纳机械系统
- 管辖: 第一性原理
2楼2012-03-11 17:54:28
天棚元帅
木虫 (著名写手)
- 应助: 100 (初中生)
- 金币: 3141.3
- 散金: 625
- 红花: 3
- 帖子: 1186
- 在线: 283.9小时
- 虫号: 609050
- 注册: 2008-09-21
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-03-11 20:39:10
4楼2012-03-11 22:21:25
enola
捐助贵宾 (正式写手)
- 1ST强帖: 2
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 1485.9
- 散金: 1549
- 红花: 14
- 帖子: 847
- 在线: 102.5小时
- 虫号: 947564
- 注册: 2010-01-24
- 专业: 半导体光电子器件
5楼2012-03-12 16:41:59
6楼2012-03-14 16:23:53
wyxhenu
新虫 (小有名气)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 3075.5
- 散金: 772
- 红花: 5
- 帖子: 279
- 在线: 250.6小时
- 虫号: 700545
- 注册: 2009-02-13
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
7楼2012-03-14 16:55:14
8楼2012-03-14 17:06:40
9楼2012-04-17 08:59:40
10楼2013-11-12 22:22:13
投票:
10