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zhang8826857

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳跑的时间长了是不是就会出现拖尾呀?

我昨天跑了个琼脂糖凝胶电泳,1%的,胶配的挺长,多跑了一倍的时间,跑了一会我拿出来看了看,条带很好,我又放进去跑了会儿,然后就拖尾了,是跑的时间太长造成的吗
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好孩子!
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zbxky

铁虫 (小有名气)

1.    PCR产物出现拖尾的因素有很多,总结为一条,就是非特异性扩增过多。原因可能是:
(1)    模板不纯:纯化模板
(2)    Buffer不合适:更换Buffer
(3)    退火温度偏低:适当提高退火温度
(4)    酶量过多:适量用酶,或调换另一种酶
(5)    dNTP、Mg2+浓度偏高:适当降低dNTP和镁离子的浓度
(6)    循环次数过多:减少循环次数
(7)    模板量少或引物量过多:增加模板量,减少引物的用量

2.    提质粒的时候经常有这种个现象,有可能是样品浓度过高了。这种情况简单,稀释一下就行了。

3.    提基因组DNA的时候也常出现拖尾,最可能的就是提的DNA中掺杂有蛋白质,蛋白质会拽DNA的泳动。所以一定要注意提取基因的操作,减少蛋白质等杂质的出现。

4.    样品破碎或是被降解

5.    存在RNA:DNA前面的一片一般都是未清除的RNA,经过纯化,RNAse处理,就没有了

6.    电泳体系的问题:观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照
(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染:。建议更换缓冲液。
(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样。
(3)电压太高:适当降低电压
(4)根据核酸片断大小,适当把加大凝胶浓度。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb 的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%, 分离大于10kb的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。英格恩
11楼2015-09-21 16:55:23
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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zhang8826857: 金币+2, 有帮助 2012-04-30 22:14:38
时间长了会有扩散效应的。
2楼2012-03-11 10:51:22
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zhang8826857

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-03-11 10:51:22:
时间长了会有扩散效应的。

我这电泳时属于扩散造成的吗?
好孩子!
3楼2012-03-11 10:54:32
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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zhang8826857(金币+3): 有帮助 2012-03-11 21:49:24
小丹木木(金币+3, 专家考核): 西瓜斑斑总是很热心的, 2012-03-12 10:06:05
时间长,电压大,都会使条带更加扩散,如果降解了也会有拖尾。
你具体的电压和电泳时间是多少?是不是做胶回收的?胶回收跑胶时间很长,条带拖一点尾很正常。你看看maker,maker也一样拖尾,那就没什么异常了。
4楼2012-03-11 16:22:09
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