24小时热门版块排行榜    

查看: 2109  |  回复: 16

daiyulan85

木虫 (正式写手)

[求助] 这种激发态扫描图是怎么做的(Linear interpolation step不知道具体是指什么)

如题,看起来应该是横坐标是扫描的步数,但是这个Linear interpolation step具体是指什么呢?google查到了Linear interpolation 的意思(Linear interpolation is a method of curve fitting using linear polynomials),仅仅是设定某一个参数进行激发态扫描吗?求解。

Energies of the S0,S1,S2,S3 excited states along the LIIC connecting the FCpoint to the S1(2APB) for 5’-2APT-3'
回复此楼
计算化学光谱
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 09:17:23
应该就是在初始值的基础上加上去的步数,我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数
2楼2012-03-07 09:10:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

daiyulan85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 070241078 at 2012-03-07 09:10:08:
应该就是在初始值的基础上加上去的步数,我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数

你的是激发态扫描吗?你说的那种情况也可以,就是不知道是不是图中的那一种。感觉他是在两个点之间之间取值,并且在这个两个点的直线上。
计算化学光谱
3楼2012-03-07 09:20:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵,谢谢 2012-03-08 19:26:23
是啊,也是激发态势能曲线扫描。应该都是一样的吧,不管横坐标怎么样,表示的意义都差不多。你要是用上面这种图,可能需要注明你的步长值?我也是初学者,所以也就了解到这种程度啦!
4楼2012-03-07 09:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 17:00:36
这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标(3N-6个)之间插值扫描出来的。
比如第一个构型的某个键长为1.2,而最后一个构型的该键长为1.3,那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27,1.28,1.29。依次类推,对所有的3N-6个坐标都做一样的处理。

这个实现起来也很简单,只需要知道第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix,然后对Z-Matrix中的3N-6个值进行差值即可。
几点注意事项:第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix中的原子序号和内坐标必须完全一致;键长和键角可以之间用N_start+(N_end-N_start)/n*i 的方式来处理,但是二面角不可以这么处理,需要根据差值的大小做一点特殊处理,否则插值出来的结构就会完全乱套,几个原子会完全挤在一起。
5楼2012-03-07 10:22:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 070241078 at 2012-03-07 09:10:08:
应该就是在初始值的基础上加上去的步数,我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数

这个只是对某一个参数的扫描,而LIIC是对所有内坐标做差值扫描出来的。
6楼2012-03-07 10:26:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

viger87

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
御剑江湖(金币+4): 呵呵,谢谢 2012-03-08 19:26:36
All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in this case the conical intersection. The interpolation parameter e is changed in the interval from 0 (for reactant) to 1 (for product – conical intersection S0–S1 ) with a step of 0.1.
也就是把产物的坐标减去反应物的坐标,然后n等分这个值,再一份一份的把这个等分的值加上反应物的坐标,就是要的每个状态的坐标了
有花堪折直须折,末待花落空折枝!
7楼2012-03-07 18:59:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daiyulan85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-07 10:22:05:
这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标(3N-6个)之间插值扫描出来的。
比如第一个构型的某个键长为1.2,而最后一个构型的该键长为1.3,那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27 ...

那请问在扫描的时候是怎么处理的呢?是每一个值都要扫一遍(比如说键长从1.2扫到1.27,每一步为0.01),还是处理完所有的值,得到所有构型再扫描?这么多构型怎么操作呢?
计算化学光谱
8楼2012-03-08 08:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daiyulan85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by viger87 at 2012-03-07 18:59:47:
All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in t ...

不知道这个conical intersection 的坐标是怎么得到的,我看原文有一句这样的话:The LIIC between initial FC point and S1(2APB) are shown in Figure 3,这个FC point 就是S0的结构吗?
计算化学光谱
9楼2012-03-08 08:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

070241078

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-07 10:26:04:
这个只是对某一个参数的扫描,而LIIC是对所有内坐标做差值扫描出来的。

谢谢你的意见啊
10楼2012-03-08 09:19:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 daiyulan85 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[考研] 材料学调剂 +4 提神豆沙包 2026-02-28 4/200 2026-02-28 18:26 by houyaoxu
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +3 ieewxg 2026-02-25 3/150 2026-02-28 18:25 by addressing
[考研] 高分子化学与物理调剂 +4 好好好1233 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:20 by liqiongjy
[教师之家] 版面费该交吗 +15 苹果在哪里 2026-02-22 18/900 2026-02-28 18:20 by mibaomingg
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂;
[考研] 材料类求调剂 +4 wana_kiko 2026-02-28 4/200 2026-02-28 18:08 by djennjx
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:02 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +3 repeatt?t 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:00 by houyaoxu
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +3 弗格个 2026-02-28 5/250 2026-02-28 17:04 by sandychj
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +4 礼堂丁真258 2026-02-28 6/300 2026-02-28 16:18 by 求调剂zz
[考研] 295求调剂 +4 19171856320 2026-02-28 4/200 2026-02-28 13:39 by ms629
[考研] 290求调剂 +4 材料专硕调剂; 2026-02-28 5/250 2026-02-28 13:32 by houyaoxu
[考研] 272求调剂 +3 田智友 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:31 by 王加浩to
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[基金申请] 面上可以超过30页吧? +12 阿拉贡aragon 2026-02-22 13/650 2026-02-26 22:09 by Hahaxia
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见