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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 这种激发态扫描图是怎么做的（Linear interpolation step不知道具体是指什么）
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daiyulan85

木虫 (正式写手)

[求助] 这种激发态扫描图是怎么做的（Linear interpolation step不知道具体是指什么）

如题，看起来应该是横坐标是扫描的步数，但是这个Linear interpolation step具体是指什么呢？google查到了Linear interpolation 的意思（Linear interpolation is a method of curve fitting using linear polynomials），仅仅是设定某一个参数进行激发态扫描吗？求解。

Energies of the S0,S1,S2,S3 excited states along the LIIC connecting the FCpoint to the S1(2APB) for 5’-2APT-3'
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计算化学光谱
1楼 2012-03-06 21:37:24
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

070241078

金虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 09:17:23
应该就是在初始值的基础上加上去的步数，我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数
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2楼2012-03-07 09:10:08
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 070241078 at 2012-03-07 09:10:08:
应该就是在初始值的基础上加上去的步数，我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数

你的是激发态扫描吗？你说的那种情况也可以，就是不知道是不是图中的那一种。感觉他是在两个点之间之间取值，并且在这个两个点的直线上。
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计算化学光谱
3楼2012-03-07 09:20:32
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070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:26:23
是啊，也是激发态势能曲线扫描。应该都是一样的吧，不管横坐标怎么样，表示的意义都差不多。你要是用上面这种图，可能需要注明你的步长值？我也是初学者，所以也就了解到这种程度啦！
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4楼2012-03-07 09:27:33
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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gmy1990(金币+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 17:00:36
这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标（3N-6个）之间插值扫描出来的。
比如第一个构型的某个键长为1.2，而最后一个构型的该键长为1.3，那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27,1.28,1.29。依次类推，对所有的3N-6个坐标都做一样的处理。

这个实现起来也很简单，只需要知道第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix，然后对Z-Matrix中的3N-6个值进行差值即可。
几点注意事项：第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix中的原子序号和内坐标必须完全一致；键长和键角可以之间用N_start+（N_end-N_start)/n*i 的方式来处理，但是二面角不可以这么处理，需要根据差值的大小做一点特殊处理，否则插值出来的结构就会完全乱套，几个原子会完全挤在一起。
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5楼2012-03-07 10:22:05
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 070241078 at 2012-03-07 09:10:08:
应该就是在初始值的基础上加上去的步数，我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数

这个只是对某一个参数的扫描，而LIIC是对所有内坐标做差值扫描出来的。
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6楼2012-03-07 10:26:04
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viger87

木虫 (正式写手)

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御剑江湖(金币+4): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:26:36
All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in this case the conical intersection. The interpolation parameter e is changed in the interval from 0 (for reactant) to 1 (for product – conical intersection S0–S1 ) with a step of 0.1.
也就是把产物的坐标减去反应物的坐标，然后n等分这个值，再一份一份的把这个等分的值加上反应物的坐标，就是要的每个状态的坐标了
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有花堪折直须折，末待花落空折枝！
7楼2012-03-07 18:59:47
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-07 10:22:05:
这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标（3N-6个）之间插值扫描出来的。
比如第一个构型的某个键长为1.2，而最后一个构型的该键长为1.3，那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27 ...

那请问在扫描的时候是怎么处理的呢？是每一个值都要扫一遍（比如说键长从1.2扫到1.27，每一步为0.01），还是处理完所有的值，得到所有构型再扫描？这么多构型怎么操作呢?
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计算化学光谱
8楼2012-03-08 08:43:27
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by viger87 at 2012-03-07 18:59:47:
All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in t ...

不知道这个conical intersection 的坐标是怎么得到的，我看原文有一句这样的话：The LIIC between initial FC point and S1(2APB) are shown in Figure 3，这个FC point 就是S0的结构吗？
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计算化学光谱
9楼2012-03-08 08:52:04
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070241078

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-07 10:26:04:
这个只是对某一个参数的扫描，而LIIC是对所有内坐标做差值扫描出来的。

谢谢你的意见啊
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10楼2012-03-08 09:19:21
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