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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 这种激发态扫描图是怎么做的（Linear interpolation step不知道具体是指什么）
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070241078

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2012-03-08 19:26:53
引用回帖:
9楼: Originally posted by daiyulan85 at 2012-03-08 08:52:04:
不知道这个conical intersection 的坐标是怎么得到的，我看原文有一句这样的话：The LIIC between initial FC point and S1(2APB) are shown in Figure 3，这个FC point 就是S0的结构吗？

应该不是吧，FC是基态分子受到光激发之后垂直跃迁到的一个区域（Frank-Condon区），这个区域分子的构型未发生变化，会接着经历一个振动弛豫的非辐射跃迁到达该激发态上相对稳定的构型，继续发生别的变化。算Conical时，需要先找一个与Conical接近的初始构型，再加上你要算的相关态的一些指令。Molpro算就可以
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11楼2012-03-08 09:29:31
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:27:03
引用回帖:
8楼: Originally posted by daiyulan85 at 2012-03-08 08:43:27:
那请问在扫描的时候是怎么处理的呢？是每一个值都要扫一遍（比如说键长从1.2扫到1.27，每一步为0.01），还是处理完所有的值，得到所有构型再扫描？这么多构型怎么操作呢?

每一步的构型都是在前一步的构型上对3N-6个坐标加上一个值得到的，每个坐标要加的值就是（N_end-N_start)/n，所以要插值几个点，就有几个构型，很少的，一般两个坐标之间10个点左右就足够了。
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12楼2012-03-08 11:30:02
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:27:22
引用回帖:
9楼: Originally posted by daiyulan85 at 2012-03-08 08:52:04:
不知道这个conical intersection 的坐标是怎么得到的，我看原文有一句这样的话：The LIIC between initial FC point and S1(2APB) are shown in Figure 3，这个FC point 就是S0的结构吗？

conical intersection是势能面交叉点的构型，需要通过优化得到，CASSCF可以优化得到势能面交叉点的构型。FC Point就是S0的结构，这个是没有问题的。
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13楼2012-03-08 11:31:55
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:27:33
Columbus软件可以做LIIC，里面有个perl的脚本lic.pl，如果看懂了可以自己写一个，因为那个脚本是针对columbus的。
http://www.univie.ac.at/columbus ... mentation_main.html
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14楼2012-03-08 11:45:38
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:27:43
引用回帖:
14楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-08 11:45:38:
Columbus软件可以做LIIC，里面有个perl的脚本lic.pl，如果看懂了可以自己写一个，因为那个脚本是针对columbus的。
http://www.univie.ac.at/columbus/docs_COL70/documentation_main.html

打开网址后，点击左边的Potential curve，查看Lic.pl的说明。
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15楼2012-03-08 11:47:34
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by pwzhou at 2012-03-08 11:47:34:
打开网址后，点击左边的Potential curve，查看Lic.pl的说明。

好的，谢谢
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计算化学光谱
16楼2012-03-08 20:25:48
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viger87

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by daiyulan85 at 2012-03-08 08:52:04:
不知道这个conical intersection 的坐标是怎么得到的，我看原文有一句这样的话：The LIIC between initial FC point and S1(2APB) are shown in Figure 3，这个FC point 就是S0的结构吗？

没看到你的文献，不过s0应该是初始结构，s1是后面的结构，然后找中间的一些结构出来做成一个liic。
“conical intersection” 这个你不用理他，是一篇文献用来描述产物的，你只需要找产物的坐标就行了
我没做个这个liic，我个人的想法是用gaussview把反应物和生成物的另存为gjf（保存是时候勾上“write cartesis”），然后产生的坐标有x，y，z坐标，对应着减下来再平分。。。。仅供参考
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有花堪折直须折，末待花落空折枝！
17楼2012-03-13 20:36:02
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