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daiyulan85木虫 (正式写手)
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[求助]
这种激发态扫描图是怎么做的（Linear interpolation step不知道具体是指什么）
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如题，看起来应该是横坐标是扫描的步数，但是这个Linear interpolation step具体是指什么呢？google查到了Linear interpolation 的意思（Linear interpolation is a method of curve fitting using linear polynomials），仅仅是设定某一个参数进行激发态扫描吗？求解。 Energies of the S0,S1,S2,S3 excited states along the LIIC connecting the FCpoint to the S1(2APB) for 5’-2APT-3' |
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【答案】应助回帖
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gmy1990(金币+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 17:00:36
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daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 17:00:36
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这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标（3N-6个）之间插值扫描出来的。 比如第一个构型的某个键长为1.2，而最后一个构型的该键长为1.3，那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27,1.28,1.29。依次类推，对所有的3N-6个坐标都做一样的处理。 这个实现起来也很简单，只需要知道第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix，然后对Z-Matrix中的3N-6个值进行差值即可。 几点注意事项：第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix中的原子序号和内坐标必须完全一致；键长和键角可以之间用N_start+（N_end-N_start)/n*i 的方式来处理，但是二面角不可以这么处理，需要根据差值的大小做一点特殊处理，否则插值出来的结构就会完全乱套，几个原子会完全挤在一起。 |
5楼2012-03-07 10:22:05
pwzhou
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御剑江湖(金币+4): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:26:36
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御剑江湖(金币+4): 呵呵，谢谢 2012-03-08 19:26:36
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All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in this case the conical intersection. The interpolation parameter e is changed in the interval from 0 (for reactant) to 1 (for product – conical intersection S0–S1 ) with a step of 0.1. 也就是把产物的坐标减去反应物的坐标，然后n等分这个值，再一份一份的把这个等分的值加上反应物的坐标，就是要的每个状态的坐标了 |
7楼2012-03-07 18:59:47
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