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汕头大学海洋科学接受调剂
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daiyulan85

木虫 (正式写手)

[求助] 这种激发态扫描图是怎么做的(Linear interpolation step不知道具体是指什么)

如题,看起来应该是横坐标是扫描的步数,但是这个Linear interpolation step具体是指什么呢?google查到了Linear interpolation 的意思(Linear interpolation is a method of curve fitting using linear polynomials),仅仅是设定某一个参数进行激发态扫描吗?求解。

Energies of the S0,S1,S2,S3 excited states along the LIIC connecting the FCpoint to the S1(2APB) for 5’-2APT-3'
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计算化学光谱
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daiyulan85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 070241078 at 2012-03-07 09:10:08:
应该就是在初始值的基础上加上去的步数,我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数

你的是激发态扫描吗?你说的那种情况也可以,就是不知道是不是图中的那一种。感觉他是在两个点之间之间取值,并且在这个两个点的直线上。
计算化学光谱
3楼2012-03-07 09:20:32
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070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 09:17:23
应该就是在初始值的基础上加上去的步数,我的势能面曲线图横坐标是以一定的步长间隔的二面角的度数
2楼2012-03-07 09:10:08
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070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵,谢谢 2012-03-08 19:26:23
是啊,也是激发态势能曲线扫描。应该都是一样的吧,不管横坐标怎么样,表示的意义都差不多。你要是用上面这种图,可能需要注明你的步长值?我也是初学者,所以也就了解到这种程度啦!
4楼2012-03-07 09:27:33
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金币+10): ★★★很有帮助 2012-03-07 17:00:36
这个是在第一个构型和最后一个构型的所有内坐标(3N-6个)之间插值扫描出来的。
比如第一个构型的某个键长为1.2,而最后一个构型的该键长为1.3,那么中间9个点的构型该键长为1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27,1.28,1.29。依次类推,对所有的3N-6个坐标都做一样的处理。

这个实现起来也很简单,只需要知道第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix,然后对Z-Matrix中的3N-6个值进行差值即可。
几点注意事项:第一个结构和最后一个结构的Z-Matrix中的原子序号和内坐标必须完全一致;键长和键角可以之间用N_start+(N_end-N_start)/n*i 的方式来处理,但是二面角不可以这么处理,需要根据差值的大小做一点特殊处理,否则插值出来的结构就会完全乱套,几个原子会完全挤在一起。
5楼2012-03-07 10:22:05
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