24小时热门版块排行榜    

查看: 12223  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

vvkaka

金虫 (小有名气)

[求助] 求问:解读NCBI 保守结构域分析结果

由于基础知识薄弱,利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后,对显示的结果看不大明白。向各位求教,望多多相助并详细解答,谢谢!
分析结果如附件显示,请问:
1.分析结果中的sepcific hits 指的是什么?
2.分析结果中的superfamilies指的是什么?为什么一段序列会出现多个家族的
信息?superfamilies这一行中第二个TPP-enzym跟TPP-enzymes不一样吗?
3.Multi-domains中文含义又指的是什么?为什么在NCBI上分别用blastp搜索后的结果跟专用conserved domains 程序搜索后该行显示的数据不一致呢?
4.用专业的语言怎样准确分析图片中的结果呢?
今天搜索了几篇文献,看了后感觉表述也不是太清楚。
问题比较多,也比较啰嗦,望多多相助!

blastp搜索出来的结果



conserved domains工具搜索出来的结果
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

分子白痴

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wanhscn at 2012-03-07 14:08:28
superfamilies  一个是 TPP_enzymes 还有一个是TPP_enzyme_PYR 两个不一样,后面那个包含了 PYR/PP interface 结构域

sepcific hits 你所blast的具体可能是什么蛋白,superfamilies 就是说你这个蛋白有可能属于哪 ...

大神大神,同问我也不会分析这个图,能不能再说清楚点呢?多谢多谢
11楼2017-12-20 10:13:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 vvkaka 的主题更新
信息提示
请填处理意见