24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3645  |  回复: 7

xiaoyang123

金虫 (小有名气)

[求助] 如何对质粒进行鉴别

从菌中提取了质粒,想知道它是哪种质粒,该如何进行鉴别呢?
有哪些特异性的位点,标志基因,可以作为某类质粒的标志么,通常质粒是如何进行标识的?

如果将质粒测序,该如何查找现有的质粒信息进行比对,以确定该质粒为何种质粒?(质粒信息通常应当从文献中查找,或者是有现成的数据库呢?)

另外,如何确定质粒的大小?由于质粒有线性,超螺旋和开环三种状态,且一般的电泳分辨率不够高,用什么方法才能够有效地确定质粒的大小呢?

以上问题,还请高人指教。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
质粒不大的话,测序可以知道很多信息!
jiayoubashaonian
2楼2012-03-01 16:28:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoyang123(金币+2): 有帮助 2012-03-02 09:48:30
测序知道的信息更多。
单酶切电泳能判断质粒的大小(不是很精确)。
3楼2012-03-01 18:03:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

srlee

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3): 鼓励积极应助! 2012-03-01 18:10:25
xiaoyang123(金币+5): ★★★很有帮助 2012-03-02 09:48:16
1)第一个问题没太看明白,你问的是这个菌中本身就存在的内源性质粒,还是人工构建的质粒在菌中而你现在分不清是什么质粒了?
2)载体质粒通常都是根据需要由一些功能序列元件构成的,不同的质粒有不同的功能,如质粒中不同抗性就是其中一种。
3)跑电泳基本上能确定一个质粒的大小范围,如果更加有效地确定的质粒大小送去测个序就好了,现在测序技术这么高也要不了多少钱!
4)如果质粒有序列了,那后面具体操作和实验分析就很好办了!
祝实验顺利!
4楼2012-03-01 18:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang123

金虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by srlee at 2012-03-01 18:04:01:
1)第一个问题没太看明白,你问的是这个菌中本身就存在的内源性质粒,还是人工构建的质粒在菌中而你现在分不清是什么质粒了?
2)载体质粒通常都是根据需要由一些功能序列元件构成的,不同的质粒有不同的功能,如 ...

感谢你的回答

关于第一个问题,这个质粒是菌中本身就存在的内源性质粒。

有考虑进行测序,但目前的问题是,即使测通了全质粒,不知道该如何同现有的数据库信息进行比对,也就是说无法确定它是某种已知质粒,或者未知质粒,从而,要进行进一步的分析就比较具有盲目性了,而且可能会做许多重复性工作,这是我苦恼的问题所在。
5楼2012-03-02 09:48:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KANG1JING

新虫 (初入文坛)

我跟楼主有一样的困扰
6楼2013-04-26 10:47:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cathyqiqi

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaoyang123 at 2012-03-02 09:48:03
感谢你的回答

关于第一个问题,这个质粒是菌中本身就存在的内源性质粒。

有考虑进行测序,但目前的问题是,即使测通了全质粒,不知道该如何同现有的数据库信息进行比对,也就是说无法确定它是某种已知质粒, ...

我现在也面临这样的问题,我们的质粒也进行了测序,但是不知道下一步该怎么办,请问楼主解决了么?
7楼2014-05-29 17:39:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zans2009

铜虫 (初入文坛)

楼主完成实验了吧,请问未知质粒是怎么测序的?不需要设计引物吗?如果需要引物,楼主是怎么设计的?
8楼2014-08-30 10:48:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaoyang123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 338求调剂 +3 我想上岸ii 2026-04-05 3/150 2026-04-05 19:59 by nepu_uu
[考研] 0703化学调剂325分 +9 15771691647 2026-04-04 9/450 2026-04-05 11:39 by 猪会飞
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 材料调剂 +18 一样YWY 2026-04-02 19/950 2026-04-04 22:14 by hemengdong
[考研] 283求调剂 +4 mcbbc 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:51 by imissbao
[考研] 309分085801求调剂 +11 MY_angel 2026-03-31 11/550 2026-04-04 19:11 by 蓝云思雨
[考研] 333求调剂 +9 阿科逸 2026-03-31 9/450 2026-04-04 18:25 by macy2011
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 278求调剂 +6 Yy7400 2026-04-03 6/300 2026-04-04 09:53 by zhangdingwa
[考研] 总分328生物与医药考数学求调剂 +7 aaadim 2026-04-02 9/450 2026-04-03 22:53 by syh9288
[考研] 机械专硕297 +3 Afksy 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:24 by 1753564080
[考研] 工科341分调剂 +3 洛多罗 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:20 by 1753564080
[考研] 303求调剂 +3 一色清羽 2026-04-02 4/200 2026-04-03 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 0856初试324分求调剂 +6 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 11:42 by 星空星月
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 285求调剂 +11 AZMK 2026-04-01 11/550 2026-04-01 22:40 by peike
[考研] 070300化学279求调剂 +15 哈哈哈^_^ 2026-03-31 17/850 2026-04-01 21:37 by 给你你注意休息
[考研] 本2一志愿C9-333分,材料科学与工程,求调剂 +9 升升不降 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:01 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +8 11ggg 2026-03-30 8/400 2026-03-31 13:56 by nanaliuyun
信息提示
请填处理意见