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purple~sky

铜虫 (小有名气)

[求助] 第一次提DNA,急求方法:油菜DNA,用于PCR~~谢各位大侠

各位高手大侠们,小女子由于跨专业,所以很多基础实验都不甚明了,现做实验需要从油菜中提取DNA,希望可以得到各位的指点和帮助……
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longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 欢迎常来本版啊,呵呵 2012-02-29 10:04:29
油菜估计不算难提的植物吧?虽然提过很多植物,由于没法采到一直没机会呢。
鉴于你是第一次提,就自己配点试剂手提法练练手看是一个什么结果。
一般流程:
1、样品裂解
液氮研磨油菜成粉末状,然后转移至含裂解液(含RNase)离心管中,充分混匀。65度水浴30-60min,期间混匀数次。
2、除杂
  加酚/氯仿抽提去除杂质。离心取上清。
3、沉淀
  加入乙醇或异丙醇沉淀DNA。离心沉淀下来用70%乙醇洗涤两次干燥后加入TE溶解即可。

ps:裂解液一般百度或查一下文献即有,可以尝试CTAB的。
以上方法有毒,如果经费允许也可以直接买个试剂盒提。简单省事,但学到的东西肯定不如自己手提。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

伟大航线....
2楼2012-02-29 09:50:04
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purple~sky

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by longrna at 2012-02-29 09:50:04:
油菜估计不算难提的植物吧?虽然提过很多植物,由于没法采到一直没机会呢。
鉴于你是第一次提,就自己配点试剂手提法练练手看是一个什么结果。
一般流程:
1、样品裂解
液氮研磨油菜成粉末状,然后转移至含裂 ...

谢谢~~有没具体点的,大概原理我知道,但是具体操作中的用量问题,时间问题等
3楼2012-02-29 09:57:54
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longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


wanhscn(金币+3, 专家考核): 热心应助,加入专家考核! 2012-02-29 13:53:34
purple~sky: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-04-01 19:53:50
新鲜的油菜:
小提:研磨你可以多研一些,转移粉末可以用100mg,加入600-700ul左右裂解液。(我的做法是:使用2ml离心管,加入600ul裂解液后放置于电子天平上,然后用小药勺小心拨取样品于管内。不用很精确,约100mg即可)
水浴裂解后可以稍为离心一下去除渣子,取上清后加入等体积的酚氯仿抽提,然后离心取上清,再加入等体积的异丙醇。
ps:你用来做PCR的话小提应该也够了,油菜也不像DNA产量少的样品,100mg应该可以提个10来ug的DNA
伟大航线....
4楼2012-02-29 10:09:58
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dingke_s

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 很热心哦,欢迎常来本版 2012-03-01 17:07:56
我们实验室这边提的的是油菜种子的基因组DNA,你如果提油菜叶子的也可以。我们用的方法是CTAB(十六烷基三甲基溴化胺)法。试验流程你可以参考分子生物学相关书籍或百度搜索,以下你可以参考:  
①称取干燥新鲜叶片约0.4 g置于干净的研钵中,剪成小片,加液氮充分研磨,至粉末呈浅灰绿色即可。
②将磨碎的粉末等量分装于4个1.5 mL的微量离心管中,各加1 mL预热(约50 ℃)的2×CTAB缓冲液[含2% CTAB(Cetyltrimethy Ammonium Bromide,Sigma),1.4 mol/L NaCl,25 mmol/L EDTA,100 mmol/L Tris-Cl,pH8.0,0.2%β-巯基乙醇(V/M)],充分摇匀。
③60 ℃保温1.5 h(如果时间不允许的话,可以适当缩短),每隔15 min~20 min摇匀一次。然后室温放置30 min,其间摇动1~2次。
④10 000 r/min离心5 min,弃沉淀,取上清液移至新管,加酚-氯仿-异戊醇至满管,并用力摇匀。
⑤10 000 r/min离心10 min,弃沉淀,取上清液移至新管,加氯仿-异戊醇至满管,并用力摇匀。
⑥10 000 r/min离心10 min,弃沉淀,取上清液。先加1/10体积预冷(4 ℃)的3 mol/L NaAc,再加预冷(4 ℃)的异丙醇至新管,将离心管轻轻翻转几次(约5 s),-20 ℃放置2 h以上或过夜。
⑦10 000 r/min离心10 min,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗脱2次,再用无水乙醇洗脱一次。晾干(或用灭菌过的滤纸吸干)后,加50 μL 1×TE溶液溶解。
⑧加入1 μL 10 mg/mL的RNase溶解DNA,30 ℃水浴或室温1 h去除RNA,置-20 ℃保存备用。
电泳检测:取5 μL DNA加1 μL上样缓冲液,于1%的琼脂糖凝胶(含0.5 μg/μL EB)中电泳检测.
建议:如果你之前没做过分子实验的话,最好还是找个师兄师姐带着你做。提前把试剂配制出来。或者买现成的植物基因组DNA提取试剂盒。  
5楼2012-03-01 14:01:32
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purple~sky

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by dingke_s at 2012-03-01 14:01:32:
我们实验室这边提的的是油菜种子的基因组DNA,你如果提油菜叶子的也可以。我们用的方法是CTAB(十六烷基三甲基溴化胺)法。试验流程你可以参考分子生物学相关书籍或百度搜索,以下你可以参考:  
①称取干燥新 ...

恩恩,好的~~我现在整理出来一套方案先做着试试,不行的话就参考您的……谢啦
6楼2012-03-01 14:25:54
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yixinyuan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得现在一些生物公司提供的基因组DNA试剂盒都能满足你实验要求
7楼2012-03-01 20:50:41
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紫色流星1

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我做植物的用的是惠尔的磁珠法提取的,提取的浓度比较高而且260/280比值也不错,可以一试!
8楼2012-03-27 10:58:28
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purple~sky

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 紫色流星1 at 2012-03-27 10:58:28:
我做植物的用的是惠尔的磁珠法提取的,提取的浓度比较高而且260/280比值也不错,可以一试!

谢谢……已经做出来了,CTAB发法,效果还不错
9楼2012-03-27 13:56:12
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