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win雨

银虫 (小有名气)

[求助] 生成药效团时,化合物的手性问题

最近想用DS中的Hiphop做个药效团,但看文献用Catalyst做的比较多,想知道这两者的Hiphop有何异同呢?(貌似Catalyst中药效团的功能已经被整合到DS里面,但为什么文献中还是写用的Catalyst)
1. DS中的Hiphop与Catalyst中Hiphop区别?

2.我选取的化合物含有手性,对于手性化合物我该如何处理呢?在mae里我看到有3个选项:保留原有手性,从化合物三维结构决定或自动产生所有(这三个我也不知道选哪个?)。在DS中好像没看到这项设置。
请大家多多帮忙,不胜感激!
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blue_cat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
win雨(金币+10): 有帮助 谢谢你! 2012-02-28 18:01:04
chaizhm(金币+2): 2012-02-28 18:56:42
1. DS中的Hiphop与Catalyst中Hiphop区别?
没有什么区别
2.我选取的化合物含有手性,对于手性化合物我该如何处理呢?在mae里我看到有3个选项:保留原有手性,从化合物三维结构决定或自动产生所有(这三个我也不知道选哪个?)。在DS中好像没看到这项设置。

DS在做药效团的时候对于手性没有区别
DS
3楼2012-02-28 12:56:02
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查看全部 8 个回答

win雨

银虫 (小有名气)

自己顶一下吧 请各位多多给予指导 很着急啊!
2楼2012-02-28 10:54:44
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xuzhj01

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-02-28 14:56:03
catalyst 独立程序出到4.10  而后整合进了DS 版本为4.11
软件是一样的
注意HipHop和HipGen的区别

第二个问题 个人认为需要注意手性,保持原有手性,原文没注明的尽量不用。这个问题尤其发文章时审稿人会问的。
4楼2012-02-28 14:07:18
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leo1252

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+2): 2012-02-28 18:56:57
如楼上所说,因为版本不同,得到的结果是有可能不同的。
对于化合物手型,一定要保持,如果是混旋体的实验数据,尽量不要用。
5楼2012-02-28 15:38:04
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