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liyali2009

新虫 (小有名气)

[求助] 帮忙评价这个引物

Forward primer        5-ATGCGAATTCCCAACCGTGAAAAGATGA-3               
Reverse primer        5-ATGCGGATCCGAAGGAAGGCTGGAAAA-3
问题:
1,该引物的酶切位点在哪?
2,保护碱基是?
3,引物设计的好不好?
4,引物扩增的产物片度多长?

这是小鼠实验,老师让回答这些问题,不会,紧急求助啊!谢啦。
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lvcong358

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
wenjing120(金币+1): 积极应助! 2012-02-25 12:38:05
1. 上游酶切位点 EcoRI gaattc
    下游酶切位点 BamHI ggatcc 一般六碱基的酶切位点常用,当然4个的也有,但是不常用,因为序列本身里边存在的可能性大太了
2 酶切位点左边紧挨的几个碱基就是保护碱基了
3和4是要知道原来的序列才可以判断的
为了任性而奋斗
2楼2012-02-25 10:23:52
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