应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助如何生成有机物Amber的输入文件，无PDB文件。
21/1返回列表
查看: 1237  |  回复: 4
查看全部回帖@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

903566945

金虫 (正式写手)

[求助] 求助如何生成有机物Amber的输入文件，无PDB文件。

本人小白一个，才开始摸索Amber.我想问一下，我有一个高分子晶体，知道晶体参数，我该如何生成Amber的输入文件呢？我想算的是我的高分子晶体与蛋白质的相互作用。最好有详细的操作过程指点。金币不是问题，现在只是抛砖引玉而已，如有高手指点，金币大量奉上。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2012-02-21 14:27:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
903566945(金币+2): 2012-03-02 15:05:37
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-15 22:00:19
使用其他软件 建立好你的高分子晶体结构，保存为pdb格式，使用amber进行操作，把高分子看做是配体小分子。
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-02 10:41:50
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 903566945 的主题更新
21/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭