| 查看: 1086 | 回复: 3 | |||
tuwenwuguan新虫 (正式写手)
|
[求助]
帮忙看看审稿意见：有关分子动力学模拟解释蛋白与底物相互作用
|
|
文章要求修改。分子模拟方面，我对分子模拟也不咋了解，投稿时也是想用MD作为辅助，结果被揪出来。请虾们帮忙看看这两个问题。 一个审稿意见如下： The authors describe the role of Glu as an amino acid that "drags" the substrate. this result is based upon MD simulations which occur on a nanosecond time scale. However, the catalytic activity of this enzyme is likely on the millisecond to second time scale. The authors need to provide better explanations (or provide explicit assumptions) to take into account the differences in time scale. 大概意思：MD是在纳秒范围内做，但审稿认为蛋白活性可能发生在毫秒到秒的范围，需要解释。---------看到一些文献都是在ns范围内做的嘛，但怎么解释审稿的疑问呢？ Secondly, the term "drag" implies that this movement requires energy. The authors should indicate the amount of energy that is required to achieve such movement, and also indicate if this energy expenditure is compensated for by the formation of other enthlapic or entropic interactions. Finally, the term "drag" or "dragging" should be replaced with some other term like "movement" or "repulsion". Again, "dragging" infers that the amino acid is in physical contact with the ribonucleotide, which it is not. 大概意思：drag这个动作需要能量，要计算出这个动作需要的能量是多少，并且是否需要其他能量来补充--------能量分析实在不懂，这咋计算？又咋看出是否其他能量补充？ |
回复此楼» 猜你喜欢
290求调剂
已经有7人回复
-
一志愿中南化学（0703）总分337求调剂
已经有8人回复
-
北科281学硕材料求调剂
已经有5人回复
-
求调剂一志愿南京航空航天大学289分
已经有3人回复
-
A区线材料学调剂
已经有5人回复
-
材料学硕297已过四六级求调剂推荐
已经有11人回复
-
316求调剂
已经有5人回复
-
一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂
已经有5人回复
-
一志愿武汉理工材料工程专硕调剂
已经有8人回复
-
329求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 审稿意见不确定--求指点，分子动力学模拟方向
已经有3人回复
- 糖蛋白---分子动力学模拟
已经有4人回复
- 懂化工动力学的虫虫，帮忙看看这审稿人什么意思？
已经有4人回复
- 请教分子力学与分子动力学的区别
已经有14人回复
- 【求助】关于分子动力学模拟疑惑
已经有6人回复
- 【求助】蛋白质大分子的动力学模拟
已经有3人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学中体系温度不断增加?
已经有16人回复
- 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
- 【共享】推荐一篇关于膜蛋白动力学的综述
已经有7人回复
alwens
铁杆木虫 (正式写手)
老木虫
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.45
- 金币: 5208.8
- 散金: 50
- 帖子: 994
- 在线: 806.6小时
- 虫号: 8486
- 注册: 2003-04-27
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2012-02-22 08:53:20
3楼2012-02-22 10:11:24
tuwenwuguan
新虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1827.5
- 散金: 88
- 红花: 3
- 帖子: 435
- 在线: 155.1小时
- 虫号: 401578
- 注册: 2007-06-13
- 性别: MM
- 专业: 病原真菌、真菌感染与宿主
4楼2012-02-22 21:01:16
10