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笔冰河

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质二级结构预测

请问预测蛋白质二级结构一般用什么软件呢，哪位好心人能发我一个呢，灰常感谢哈！
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1楼 2012-02-20 11:12:53
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宇宙心灵

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励积极应助哦 2012-02-20 13:38:40
笔冰河(金币+2): ★★★很有帮助 多谢了 2012-02-20 13:57:50
蛋白质二级结构预测软件有很多，各有优缺点，本人较喜欢使用一款在线的工具，是蛋白序列二级结构预测综合站点，从该网站出发，输入蛋白序列，可以根据需要，使用各种在线预测工具，包括Coils、nnPredict、PSSP/SSP、PSSP/NNSSP、SAPS、TMpred、SOUSI、Paircoil、Protein Hydrophilicity/Hydrophobicity Search、SOPM，使用十分方便。

连接地址：http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/
进去后选择"Choose a type of search from the pull-down menu”
希望对你有所帮助！祝好！
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赢在交流！
2楼2012-02-20 11:19:58
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lvtd

金虫 (小有名气)
内容已删除
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tobeornottobe,thisisaquestion!
3楼2012-02-20 11:20:54
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笔冰河

银虫 (小有名气)
内容已删除
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4楼2012-02-20 14:00:13
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笔冰河

银虫 (小有名气)
请问下用什么软件可以确定蛋白质的一级结构，即蛋白质的N、C端，重复单元的区域分布
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5楼2012-02-20 15:01:11
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笑看人生417

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
笔冰河(金币+1): ★有帮助 2012-02-22 12:43:01
1.DNAMAN，DNASTAR
2.NCBI网站
3.最推荐的一个就是bioedit 功能不是一般的强大
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6楼2012-02-20 15:41:25
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笑看人生417

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

笔冰河(金币+1): ★有帮助 2012-02-22 12:43:48
引用回帖:
5楼: Originally posted by 笔冰河 at 2012-02-20 15:01:11:
请问下用什么软件可以确定蛋白质的一级结构，即蛋白质的N、C端，重复单元的区域分布

直接分析出三级蛋白结构就行了，会出现N--C的延伸。很清楚明了，一级结构貌似就是指碱基序列，看不出N，C端吧
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7楼2012-02-20 15:44:05
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
笔冰河(金币+1): ★有帮助 2012-02-22 12:43:19
http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
选择Predict Secondary Structure (PSIPRED v3.0)
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8楼2012-02-20 16:50:21
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希罗雅

银虫 (小有名气)
http://www.expasy.ch/  也可以
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凡事学习
9楼2012-02-21 17:06:29
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leoselphin

木虫 (小有名气)
Protein Hydrophilicity  吧？？？
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10楼2012-02-26 09:27:38
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